• Forum - ADN, Sites, Membrane

[Biologie Moléculaire] Sperme de saumon

En biologie moléculaire, il est très courant d'utiliser le sperme de saumon dans les techniques d'hybridation des acides nucléiques pour saturer les membranes. Je me demande comment et quel est le principe de cette saturation Est-ce de l'ADN pur qui est dans le sperme qui sert à s'hybrider aux sites vides de la membrane.  [...] Effectivement le sperme de saumon est utilisé pour saturer les sites libres de la membrane. plus précisément, les acides nucléiques intéragissent fortement entre eux via les bases complémentaires, mais peuvent aussi intéragir via des liaisons électrostatiques (dûe aux charges de la liaison phosphate, ou au cycle des bases) avec les groupements chargés des membranes.  [...]

[Biologie Cellulaire] pH acide et bactéries

Je suis à la recherche de toute sorte d'informations sur l'effet du pH acide sur les cellules et en particulier les bactéries. Je sais que l'acidité dégrade tout, membrane, ADN etc... mais j'aimerai avoir plus de détails sur le mode d'action sur les bactéries, j'ai entendu parler d'effets sur certains acides aminés etc mais je ne suis pas sure donc si vous avez des sites ou des publications qui détaille l'effet, j'aimerai vraiment me documenter sur le sujet et je n'ai pas de cours sur le sujet.  [...] le pH peut permettre ou empêcher certaines molécules de passer la membrane plasmique (c'est le cas par exemple chez les plantes avec l'auxine, ce qu'on appelle la croissance acide à l'auxine correspond au fait qu'en pH acide les charges présentes sur l'auxine vont disparaitre et lui permettre de passer plus facilement dans la cellule puisque les charges et donc la polarité de l'auxine l'empêchait de diffuser librement et demandais la nécessité de protéines spéciales pour passer la membrane, en pH acide l'auxine peut passer meme sans protéine de transport.).  [...]

[Génétique] Retard sur gel

mais l'on voie 2 bandes car. la plus petite bande il n'y a qu'un site fixé par la protéine, la plus grande bande car il ya les 2 protéines fixés.  [...] En gros les retards sur gel sont assez chiant a interpreter, c'est pour ca que tu dois faire une piste d'ADN sans proteine, et differentes concentration de ta proteine. Sinon tu ne peux pas conclure grand chose.  [...]

[Biochimie] Western blot methanol

Je suppose donc que la tremper dans le méthanol doit dissoudre partiellement la surface hydrophobe de la membrane, révélant ainsi les sites hydrophiles permettant à la membrane de ne pas repousser les molécules polaires comme l'eau, et donc de bien faire contact avec le tampon de transfert.  [...] De plus, la constitution des membranes de transfert (nitrocellulose et PVDF) ont l'avantage de présenter des sites hydrophiles et des sites hydrophobes, optimisant ainsi leur capacité à fixer les protéines par interactions électrostatiques et hydrophobes, d'où l'intérêt supplémentaire de rendre la membrane de PVDF hydrophile.  [...]

Ions Ag+

Alors qu'il semble inerte isolément, son rôle bactériostatique est dû à l'interaction avec l'humidité de la peau ou les sécrétions des plaies. L'avidité des protéines tissulaires pour cet ion entraine des modifications de structure membranaire (et donc une diminution de la viabilité cellulaire) et une dénaturation de l'ADN et de l'ARN (avec inhibition de la réplication).  [...] Pour assurer la bactéricidie, des ions cuivre chargés positivement se lient aux sites négatifs des membranes des cellules bactériennes et permettent la pénétration des ions argent et leur effet dégénératif sur l'ADN, l'ARN, les protéines du cytosol et la respiration mitochondriale conduisant à la mort cellulaire.  [...]

enveloppe nucléaire

chez les eucaryotes, les chromosomes ne sont pas circulaires et possèdent plusieurs origines de réplications (sites d'où commencent la réplication de l'ADN par l'ouverture du duplex ADN en double-hélice pour libérer le brin matrice et la mise en place sur chaque brin d'une ADN polymérase).  [...] En fait, c'est du à la présence obligatoire de complexes au niveau de ces sites d'origine appelés pré-ORC, contenant les hélicales MCM quis ervent à dérouler l'ADN durant l'initiation de la réplication. Sans ces complexes, l'ADN même déroulé de ses histones ne peut être accessible pour la réplication.  [...]

[Biologie Cellulaire] SAR et Histones

si je comprends bien, les sar sont des sites d'attachement de l'adn decondensé (lorsqu'il n'ya plus d'histone) et permettent de séparer les gènes distincts.  [...] les SAR sont effectivement des sites d'attachement de l'ADN à la matrice nucléaire. Ces sites sont généralement situés au voisinage des origines de réplication, d'où peut être l'abus de langage pour dire qu'il sépare deux gènes (mais attention, ce n'est pas une définition).  [...]

[Biologie Moléculaire] polymorphisme de restriction

C'est une séquence de l'ADN qui peut être reconnue par une enzyme de restriction. Les enzymes de restriction sont des protéines capables de reconnaître ces sites et de couper l'ADN à ce niveau. Les sites de restriction ont la particularité d'être des site palyndromiques, c'est-à-dire qu'ils sont les mêmes dans un sens ou dans l'autre.  [...] En lisant cet article, vous comprendrez d'une petite modification de la séquence d'ADN peut faire apparaître ou disparaître un de ces sites de restriction, et que ce phénomène peut être exploité pour détecter ces polymorphismes.  [...]

[Biotechnologie] Terminateur de transcription

a) les sites Nut, qui une fois transcrits sont des sites de liaisons pour une hélicase (la fameuse Rho) qui migre sur l'ARN, rattrape l'ARN pol et dissocie le complexe ADN..ARN, si bien que l'ARN pol aussi est élaguée de l'ADN. Les sites Nut sont suivie de sites de pauses (des tiges-boucles) ce qui favorise Rho.  [...] Il est possible que la séquence terminateur ait été prise sur un modèle bien connu, tel le phage lambda, mais qu'il comporte aussi un site antiterminateur. or pour qu'il y ait antiterminaison, il faut la présence d'une protéine (N chez lambda je crois), donc si ta souche ne le code pas, cela peut le faire.  [...]

[Biochimie] Manipulation de l'ADN: plasmide

Les plasmides utilisés en recherche sont souvent des plasmides très modifiés par les sociétés qui les vendent. Afin de pouvoir insérer facilement des portions d'ADN d'intérêt dans le plasmide, on a prit l'habitude de placer des sites de restriction. C'est à dire des sites reconnus par des enzymes capables de couper l'ADN.  [...]