• Forum - ADN, Protéine, Complexe

[Microbiologie] Réponses au stress et système SOS

Lorsqu'une lésion apparaît (due à des UV le plus souvent, donc lésion du type dimère de T ), il y a mise en route du système SOS. Tu imagines une fourche de réplication et la PolIII qui avance jusqu'à arriver et buter sur le dimère de T. Elle s'arrête, mais le truc est que l'on se retrouve avec un brin d'ADN simple-brin et ça c'est maaaaal Dans la cellule, il existe naturellement une protéine appelée RecA qui a une forte affinité pour l'ADN simple-brin, donc elle vient s'y fixer et on a affaire à un nucléofilament.  [...] Ce complexe RecA-ADN simple-brin fait que la protéine RecA est activée (RecA*) et se reconnaît des fonctions protéolytiques. Une protéine appelée LexA est attirée par ce complexe RecA*-ADN simple-brin et clivée par RecA*.  [...]

[Biologie Cellulaire] technique de retard sur gel et immunoprécipitation de chromatine

Le retard sur gel permet de déterminer si le fragment d'ADN intéragit avec une protéine ou un complexe protéique (d'ou un retard de migration si tel est le cas). Mais ne donne aucune info sur l'identité de la protéine et de la séquence (même si pour la sequence il y a moyen de bricoler pour en savoir plus).  [...] Le ChiP permet de déterminer la séquence d'ADN avec laquelle une protéine ou complexe protéique connu intéragit. C'est de l'IP sauf que là avec l'anticorps on fait tomber une protéine (d'ou la nécessité de connaitre son identité) qui intéragit avec, entre autre, des bouts de chromatine (préalablement digéré).  [...]

Code génétique

Et en fait lorsqu'il y AUG cela signifie que l'ARNm va être traduit en protéine juste aprés AUG. Mais si il y a AUG en plein milieu de l'ARNm, il se passe quoi.  [...] AUG code pour la méthionine mais est aussi un codon initiateur ça veut dire que dans le fragment d'ARN la notice de fabrication de la protéine commence a partir du premier AUG qui va initier la traduction.  [...]

[Biochimie] etude de proteine de liaison à l'ADN

En gros, ta sonde libre va migrer en bas du gel, et en présence d'une interaction avec une protéine, le complexe ADN-protéine sera ralenti dans le gel puisque plus gros. il apparaitra une bande radioactive dite retardée.  [...] Selon les cas, tu peux vérifier quelle protéine interagit avec ton ADN en ajoutant a ton mix ADN+ protéines un anticorps dirigé contre ta protéine d'intéret. Dans ce cas deux solutions.  [...]

[Génétique] Retard sur gel

Donc en gros si tu as un systeme purifie ADN + proteine pure, tu as une bande si aucune fixation (ou fixation hyper forte et tout l'ADN est retarde), une ou deux bandes si tu as au moins un site de fixation de ta proteine. Attention, tu peux avoir plusieurs sites de fixations et seulement 2 bandes voire une seule (par exemple si l'affinite est si grande que tu ne peux voir les etats intermediaires).  [...] de méme pour le 2 éme complexe, si la bande à un poids moléculaires plus élevé, est ce que c'est car le complexe protéique B est plus lourd ou bien que sur cette bande il ya aussi le complexe protéique A attaché.  [...]

[Immunologie] immunoprécipitation

Dans la co immuno, tu va piocher avec un 1er anticorps ta 1ere protéine que tu soupçonne d'interagir avec une 2eme protéine. Ensuite a partir de ce complexe Anticorps/protéine que tu as purifié tu va essayer de detecter la 2eme protéine par un Western blot.  [...] Donc avec 1 anticorps tu va piocher ta protéine. Ensuite tu purifie ton complexe anticorps/protéine et tu va regarder si tu as de l'ADN fixé. soit par PCR (si tu cherche une séquence spécifique) ds la CHIP ou soit directement par autoradiographie.  [...]

[Biologie Moléculaire] Promoteur vs séquence régulatrice

- Comment peuvent-elles permettre l'expression spécifique d'une protéine Je supposais que c'était en attirant des facteurs de transcription qui se fixaient sur l'ADN et qui formaient un complexe protéique sur le promoteur... mais là, je suis un peu mêlée.  [...] Oui la fixation sur ces séquences régulatrices de protéines peut créer un édifice moléculaire qui couplé à celui du promoteur va favoriser le démarrage et la rapidité de la transcription par l'ARN polymérase II.  [...]

[Biologie Moléculaire] ADN Polymérase alpha delta epsilon

Ces trois ADN polymerase (alpha delta epsilone) interviennent dans la réplication et font toutes les trois partie de du complexe d'initiation de la réplication si je ne me trompe, avec PCNA et pas mal d'autres protéines... y a t'il quelque part un point pour savoir où en sont les recherches à ce sujet Sinon quelqu'un ici est-il en capacité de le faire.  [...] -Soit alpha synthétise les amorces ARN et les allonge sur le brin à synthèse discontinue de l'ADN naissant. Pour le brin à synthèse continue le complexe ADN polymérase delta/PCNA synthétise le brin d'ADN (PCNA est une protéine qui augmente fortement la processivité).  [...]

Phénomène de réplication (eucaryotes)

Pendant la phase d'élongation, la protéine RF-C reconnaît le complexe matrice-amorce. Elle recrute alors la protéine PCNA qui provoque le remplacement de l'ADN polymérase alpha par l'ADN polymérase gamma.  [...] En ce qui concerne le rôle des protéines adjacentes. la PCNA augmente la processivité de la polymérase delta, et en s'associant au RFC, il y'a formation d'un complexe protéique qui va assurer la coordination entre le détachement de la polymérase alpha et la fixation de la polymérase delta.  [...]

basse concentration en glucose, haute concentration en AMPc

on me dit. lorsque la concentration de glucose est basse, donc la concentration en AMPc est grande, celui si se lie à la proteine CAP et le complexe CAP-AMPc augmente l affinité de l'arn polymérase pour le brin d adn.  [...] Je te donne une réponse simple. les concentrations élevées de glucose inhibent l'adénylate cyclase de classe I, d'où une production d'AMPc faible. Et inversement.   [...]