• Forum - ADN, Peptides, Solution

[Biochimie] Trypsine ou Pronase

J'ai un TP de biochimie à faire où on doit purifier de l'ADN et à une certaine étape, on ajoute de la pronase à l'ADN pour briser les peptides en solution. Par la suite, on fait une extraction au phénol/chloroforme pour enlever les protéines et lipides de la solution contenant l'ADN. Alors, j'aimerais savoir.  [...] 1. Si on utilise de la trypsine au lieu de le pronase, cela fait en sorte que les protéines sont hydrolysées en de moins petits fragments. Ma question est. quel impact le fait d'avoir des fragments de protéine plus gros a sur le reste de la purification Est-ce que l'extraction au phénol/chloroforme sera moins efficace Si oui pourquoi.   [...]

[Biochimie] Boudin de dialyse

On soumet le surnageant à une ébullition prolongé en présence d'acide chlorhydrique pour qu'il dégrade les protéines et les peptides en acide aminé et apparemment l'amidon aussi en sucres réducteurs, d'ailleurs c'est pour ça que la solution H contient des acides aminés et des sucres réducteurs due à l'hydrolyse des protéines et de l'amidon.  [...] Le surnageant est opalescent et la solution est limpide, parce que le surnageant contient des protéines, peptides et de l'amidon qui forme une solution colloïdale dans l'eau donc opalescente, et la solution est limpide parce qu'il contient des acides aminé et des sucres réducteurs qui sont soluble dans l'eau.  [...]

Polypeptide/phytochélatine

Il faudrait déjà savoir si la question s'applique à n'importe quel type de phytochélatine, ou à une catégorie particulière, comme les métallothionéines. Ensuite, il faudrait savoir le contexte de la question.   [...] oui je veux savoir les réactions possibles des phytochélatines dans une solution d'acide phosphorique, et si possible quel est le type de phytochélatine qui préserve plus la structure des peptides.  [...]

[Biochimie] séquençage d'une proteine

L'élution se fait grâce à une solution (citée dans l'article) de plus en plus concentrée, ce qui provoque une élution séquentielle de tes peptides (vu que chaque peptide aura une affinité différente). Les peptides sont ensuite ionisés par electrospray à l'entrée du spectromètre de masse.  [...] dans la solution a analyser ya bien plusieurs peptides, est ce que la liaison peptidique entre les AA d'un meme peptide est rompu et c'est ce qui fait qu'on observe ensuite sur le profil d'élution chaque AA représenté par un pic.  [...]

ARN messager et ARN de transfert

- la transcription quant à elle consiste à synthétiser un ARN à partir d'un brin d'ADN. Ce brin d'ARN sera capable de sortir du noyau (ce que ne peut faire l'ADN) pour être lu par les ribosomes, permettant ainsi de synthétiser des peptides.  [...] Lors de la transcription, l'ARN M se déplace du noyau vers le cytoplasme pour être lu par les ribosomes, jusque là, pas de problème. Mais l'ARN T, c'est donc un acide nucléique cytoplasmique uniquement Il apporte donc les acides aminés un par un pour former ensuite la chaîne polypeptidique et ne sert à rien d'autre et par conséquent, il est alors différent de l'ARN M ( je veux dire qu'il ne vient pas du même endroit ) Peut-on m'éclairer sur ce point.  [...]

[Biologie Moléculaire] vérifier l'intégrité d'un peptide

J'ai un peptide de 1,8kDa en solution et je souhaiterais vérifier si il ne s'est pas dégradé. Je me demande par conséquent si il est possible de séparer des peptides d'un poids moléculaire de l'ordre de 1kDa voire moins en SDS-PAGE Je ne suis pas très familière des techniques de bio mol et je n'ai pas réussi a trouvé de ratio acrylamide/bis acrylamide ni de concentration de gel permettant de séparer des peptides de tailles aussi petite….  [...] J'avais également pensé cas échéant à passer la solution de peptide en HPLC avec détection UV à 280nm, mais le peptide en question ne contient que 2 a.a. absorbant à 280nm qui sont qui plus est très proches l'un de l'autre. Si le peptide est dégradé mais que les 2 tyrosines sont sur le même fragment la dégradation ne pourra pas être mise en évidence par cette technique, non.  [...]

[Biologie Moléculaire] Ribosonde

Une ribosonde est tout simplement une sonde d'ARN. Comme elle est composée de RIBOnucléotides, on ajoute ribo devant sonde pour la différencier des sondes d'ADN.  [...] Eh bien je n'ai jamais étudié la question, mais il y a deux méthodes qui me viennent à l'esprit pour synthétiser des ribosondes. Soit tu fais une transcription in vitro à partir de la séquence d'ADN voulue, soit tu fais de la synthèse en phase solide, utilisée aussi pour faire des sondes ou amorces d'ADN et des peptides.  [...]

[Immunologie] schémas sur la vaccination !

Bonjour. je voudrai svp avoir des schémas sur la vaccination si c'est possible. sur la vaccination à ADN, par peptides et par protéines.  [...] Des schémas de vaccination par ex. pour la vaccination à ADN. un schéma sur la construction du vecteur comportant le géne qui doit coder pour l'antigéne vaccinal...ou n'importe quel schéma portant sur la vaccination...ou des vidéos... merci bien.  [...]

L'origine absolue du code génétique

Et sinon, pour affirmer qu'il etait hautement improbable que l'adn se forme de ses 22 acides aminés par hasard, il faut, c'est sur, assez bien en connaitre la chimie et formuler des solutions de remplacement.  [...] ...peptides ( tout à fait l 'inverse de l'actuel)...et ptit à ptit les aa sont de plus en plus nombreux dans ces ancetre-enzymes...jusq ç l 'avenement de l'ADN... si qelqun peut m eclairer je l'attend.  [...]

[Biologie Moléculaire] Solution de blockage !!

C'est quoi une solution de blockage composée de BSA et de Tween 20, on l'a utilisée lors d'un bacterial display pour bloquer la molécule cible.  [...] le probléme c'est qu'on a d'abord mis sur une lame, notre cible, puis on a rajouté la solution de blockage...et ce n'est qu'après 45min qu'on a rajouté nos cellules (dotés de peptides à leurs surface qui lierait la cible).  [...]