• Forum - ADN, Lumière, UV

[Biologie Moléculaire] Absorption molaire de l'ADN

Je cherche à savoir pourquoi l'ADN simple brin absorbe plus que l'ADN double brin Je sais que l'absorption molaire est différente entre les 2 formes mais pourquoi et comment cela se traduit.  [...] Dans l'ADN dénaturé (ou simple brin) les bases sont très accéssible au rayonnement. alors que dans l'ADN double brin, les bases sont cachées.  [...]

Expériences en génétique…

Le bromur d'ethidium est un produit qui se fixe sur l'ADN et qui une fois en place devient fluorescent dans les ultra violets. Tu vas donc pouvoir voir tes deux bouts d'ADN dans le gel sous une lumière UV.  [...] Il n'y a pas besoin de connaitre la taille du gène (d'ailleur tu fais migrer de l'ADN ou de l'ARN et pas forcément un gène) car tu fais migrer un marqueur de taille à coté. On utilise l'électrophorèse par exemple pour contrôler les manips que l'on fait. Par exemple si tu veux voir si un gène que tu as voulu insérer est bien présent dans un plasmide, tu peux faire une restriction en coupant dans le gène hypothètique et tu calcules la taille des fragments obtenus en supposant que ton gène est présent.  [...]

[Biologie Moléculaire] Electrophorèse (ADN sur Agarose) et Bromure d'éthidium

En mettre dans le gel est suffisant pour voir aux UV les bandes d'ADN. Le problème de l'éthidium, c'est qu'il est chargé positivement et il migre donc dans le sens opposé à l'ADN. Si vous laissez migrer trop longtemps votre ADN, il peut ne plus y avoir assez d'éthidium dans le bas de votre gel et vous risquez de ne plus voir les bandes de faible masse moléculaire (vous devez d'ailleurs avoir des petits fragments vu que vous utilisez un gel à 2% non ).  [...] PS. Juste à titre indicatif, j'ai découvert cette année le SYBR Safe qui permet également de visualiser l'ADN sur gel. On ne visualise pas l'ADN aux UV mais avec une lumière bleue, ce qui évite les problèmes de dégradation de l'ADN par les UV. C'est une molécule qui a l'avantage d'être beaucoup moins (ou pas du tout ) cancérigène que le BEt, et qui ne migre pas car pas chargé.  [...]

[Biologie Moléculaire] Densité Optique a quoi sa sert en biologie ?

Les acides nucéiques absorbent la lumière à 260nm de longueur d'onde (UV). Mesurer l'absorbance à 260nm d'une solution d'ADN ou d'ARN te permet donc d'en déduire la concentration en l'un ou l'autre (loi de Beer-Lambert).  [...] Cas concret. en thèse, je produisais une protéine recombinante qui a la capacité de se lier aux ARNt. A la fin de ma première étape de purification (une colonne Ni-NTA), mes échantillons absorbaient principalement à 260 nm, preuve que ma protéine était très liée à des acides nucléiques (= les ARNt).   [...]

[Biologie Moléculaire] BET ou Bromure d'Ethidium...quelles aternatives ?

J'ai découvert le SYBR Safe l'an dernier dans le labo où je travaille. Visiblement il est de plus en plus utilisé dans les labos pour remplacer le BET. Il a l'avantage d'être beaucoup moins dangereux que le BET, et tu le visualises grâce à une lumière bleue, donc pas d'UV pour agresser ton ADN.  [...] Oui j'ai utilisé le sbyr je suis d'accord pour sa sensibilité, il faut le protéger de la lumière durant toute la migration (si tu le mets dans le gel).  [...]

Génétique

1)Quel est le nom de ce qui absorbe les UV dans l'ADN Les chromes ou quelque chose comme ça D'ailleurs pourquoi l'Adn absorbe plus la lumière quand il est dénaturé.  [...] Sachant que en dehors des cellules et de toutes les enzymes presentes l'ouverture d'un brin d'ADN se fait à environs 60°C tu comprendras aisément l'importance de cette polymerase bactérienne.  [...]

l'huile du tournesol

La conservation de l'huile est optimale à température fraiche, une cave ou un cellier, de préférence à l'abri de la lumière du soleil. L'huile se dégrade avec le temps (oxydation entre autre), qui s'accélère avec l'exposition à la lumière. Deux ans me parait la limite supérieur.  [...] 3) l'ennui avec l'oxydation, c'est que l'on ne la contrôle pas. Cela va former des radicaux libres, qui ne sont pas bon pour la santé (cause de mutation de l'ADN ==. cancer). Le meilleur moyen pour l'empêcher est de diminuer la quantité d'oxygène dans la bouteille (bien remplir la bouteille) et la protéger de la lumière (particulièrement des UV).  [...]

[Divers] Système de visualisation d'ADN en gel, fluorescence et UV!

[Divers] Système de visualisation d'ADN en gel, fluorescence et UV.  [...] Quelqu'un pourrait me conseiller d'un système simple de visualisation de gel avec caméra et lumière blue/UV pour visualiser les bandes d'acides nucléiques (ADN et ARN) dans un gel d'agarose préparé avec de BET et de Sybr safe (fluorescence).  [...]

relation du pourcentage G+C avec la Tm

Il indique simplement la relation entre l'absorbance relative d'un faisceau monochromatique de 260 nm et la température de fusion Tm. En fait, la température de fusion est la température à laquelle les deux brins de ton duplex d'ADN se séparent, et les acides nucléiques ont un pic d'absorbance pour la lumière UV à 260 nm.  [...] A la valeur de Tm, tu as en fait autant d'ADN en duplex que dissocié (ratio 1.1). En fait, la valeur de Tm est un indice de stabilité thermique qui va varier en fonction de la composition de ta séquence, mais aussi du nombre de bases. En fait, à mesure que tes duplex ADN vont se dissocier en brins individuels, l'absorbance optique de ton milieu va augmenter.  [...]

dangerosité des ultraviolets

Pourquoi alors dit-on que les ultraviolets sont dangereux pour l'homme (mutation de l'adn) et pas par exemple la lumière visible.  [...] Maintenant j'aimerais savoir pourquoi l'ADN réagi à une onde électromagnétique de longueur d'onde (153nm-400nm. UV[A,B,C]) mais n'a pas la même réaction pour une onde électromagnétique de longueur d'onde plus élevé (exemple. lumière visible). Elles ont exactement les mêmes propriétés seule la fréquence change.  [...]