• Forum - ADN, Génome, Champignon

[Biologie Moléculaire] Interprétation PCRq en temps réel (SYBER Green)

D'une part, avec la quantité d'ADN du champignon, tu calcule le nombre de génome de champignon que tu as dans ton échantillon (masse d'ADN contaminant/masse du génome du champignon). Tu obtiens n1.  [...] D'autre part, tu soustrais la masse d'ADN de champignon à l'ADN totale pour avoir la masse d'ADN restant, appartenant donc au végétale, et tu calcules le nombre de génome végétal que tu as dans ton échantillon (masse d'ADN végétal/masse du génome du végétal). Tu obtiens n2.  [...]

Qu'est ce qu'une mycorize ?

Association symbiotique entre certains champignons et les parties souterraines de diverses plantes (presque toujours chlorophylliennes). En fonction de la nature de l'organe investi par le champignon, on parlera de. mycorhize (union avec une racine), mycorhizome (union avec un rhizome), mycothalle (union avec un thalle).  [...] L'ADN total n'a aucun sens. Dans ce type de travaux, on recherche un marqueur précis, unique à l'espèce, afin de l'identifier. Il faut au contraire séparer les génomes et éviter tout amalgame (surtout entre champignon et champignon, ce qui est fréquent).  [...]

[Biologie Moléculaire] problème de qPCR sur des échantillons de maïs

je cherche à mettre au point une méthode de quantification en Evagreen d'un champignon dans des échantillons de maïs cultivés en serre, et tout a bien marché (dessin d'amorces spécifiques, quantification d'ADN du champignon pur...) mais dès que j'ai voulu passer les échantillons de maïs, j'ai obtenu des résultats non répétables, avec des pics de fluorescence qui ne correspondent pas au champignon et surtout qui changent d'un jour à l'autre.  [...] oui j'ai blasté mes oligos et j'ai fait une PCR sur de nombreuses de champignons que l'on rencontre sur le maïs, a priori elles sont spécifiques. Après je n'ai pas eu accès à de l'ADN de maïs pur (trop d'endophytes naturellement présents dans les semences) donc je ne peux pas certifier à 100% que les amorces ne s'hybrident pas avec le maïs, mais étant donné que certains échantillons (contenant 100 ng de maïs) ne réagissent pas, je ne pense pas qu'elles amplifient le maïs.  [...]

[Biochimie] champignons

tout être vivant possède un adn par définition, de la bactérie à la baleine en passant par les champignons bien sûr. Et chaque cellule de ces êtres en possèdent un exemplaire de cet adn.  [...] Mais je rétorque pour ma défense. n'est-ce pas superflu que de les énumérer toutes ( en supposant bien entendu que nous les connaissons toutes ) en réponse à un post qui demandait simplement si les champignons ont ou non un adn.  [...]

[Biologie Cellulaire] Fréquence des mutations

Voila, j'ai un document (tableau) indiquant la taille du génome ainsi que le taux de mutations spontanées par cycle cellulaire pour les levures (champignon). Taille du génome (nombre de paires de bases) = 1,4*10 7 et taux de mutations spontanées par cycle cellulaire = 1/370.  [...] Pour moi c'est G1-S-G2-M puis re G1 etc... Il y a donc la mitose, ce qui implique la réplication totale du génome chez la levure. (Donc 1,4x10 7 ).  [...]

[Génétique] La recombinaison homologue

Après l'intégration génétique d'un gène dans le génome d'un champignon (donc un eucaryote), je voudrais savoir comment je peux prouver ou contrôler que la recombinaison a été strictement homologue.  [...] Normalement chez la levure, il y a peu de NHEJ par rapport à la RH. Mais tu peux toujours utiliser la transgénèse à la thymidine kinase et sélection sur ganciclovir, pour confirmer que c'est bien une RH et non pas autre chose.   [...]

Mangez-moi, mangez-moi...

Prenons le cèpe par exemple. Il pousse selon des conditions bien spécifiques, mais c'est toujours le même champignon, quel que soit l'endroit où il pousse (la région). Il a donc le même 'génome', les mêmes propriétés.  [...] Je pense pour te répondre, que pour reproduire justement ces conditions si particulières, ayant fréquenté une champignonnière dans le passé, il faudrait des moyens qui ne justifieraient pas assez un certain rendement.  [...]

[Biologie Moléculaire] Différences entre les types de Taq ?

Quelle est la différence entre les types de Taq (qo tag, biotools, bioline...). Donnent t-elles les mêmes résultats si non quelle est la bonne pour faire une commande, sachant quelle est destinée pour une PCR d'un ADN de dermatophyte (champignon filamenteux).  [...] Si tu génotype des champignons, la qualité de la taq est peu importante vu que tu cherches à savoir si un gène est exprimé ou non.  [...]

paroi (plante)

La formation de la paroi commence à la fin de la mitose pendant la télophase. A l'inverse de la cellule animal où se forme un anneau contractile, on a des vésicules golgiens qui contient des composants de la paroi qui vont être transporté jusqu'à la zone médiane ( = au centre ).   [...] Cette zone médiane est riche en microtubule servant par exemple à la migration de l'ADN. on appelle cette zone le phragmoplaste. Le dépôt est centripète ( périphérie vers centre ) chez les algues et les champignon et le dépôt est centrifuge pour les plantes ( centre vers la périphérie ).  [...]

[Génétique] Ogm

les personnes ayant des problèmes de croissance, jusqu'à un certains moment ces derniers était traités avec des hormones de croissance prélevé chez des cadavres humains (donc tout le monde ne pouvait être traité).Avec l'apparition des OGM c'est désormais des bactéries, chez qui ont a modifié le génome qui désormais produisent des hormones de croissances humaines pour les humain.  [...] Non ca c'est de la science fiction... tu prends un fragment d'adn et tu le mets dans le lapin, l'homme, la souris, la baleine, l'elephant, la grenouille, la bacterie, la levure, un champignon etc... et ca te donnera TOUJOURS la meme protéine. et en plus il n'y a rien de magique la dedans on sait tres exactement pourquoi c'est le cas.  [...]