• Forum - ADN, Fragment, Marque

[Génétique] CGH-array

pour être plus précis, on cohybride sur une puce contenant des fragments d'ADN humain, l'ADN amplifié du patient qui est marqué dans une couleur (par exemple rouge) avec de l'ADN d'un sujet sain amplifié et marqué d'une autre couleur (par exemple vert).  [...] Dans ce cas, un fragment en nombre copie normal apparaitre jaune, un fragment délété apparaitra jaune-vert (plus d'ADN marqué en vert que d'ADN marqué en rouge) et un fragment dupliqué apparaitre jaune orangé (plus d'ADN marqué en rouge que d'ADN marqué en vert).  [...]

[Biochimie] Différence entre puce à ADN et sonde à ADN !

Une sonde à ADN est un fragment de nucléotides marqué (par un composé fluorescent, un radio-isotope ou une enzyme) que l'on utilise pour hybrider et détecter des séquences homologues, c'est-à-dire complémentaires.  [...] Une puce à ADN est un ensemble de sondes à ADN fixées en rangées ordonnées sur une petite surface.  [...]

Problème de traduction d'une recherche scientifique...

voila j'ai un problème concernant la traduction d'un mot dans une recherche scientifique... j'espère que des gens calé en la matière pourront m'aider.   [...] Tu prends un fragment d'adn correspondant à un gene cloné, des ribonucléotides tri-phosphates (atp, gtp, utp, ctp) donc un marqué radioactivement, et les protéines de la machinerie de transcription (ARNpolymérase II pour arnm) (extrait nucléaire ou protéines purifiées).  [...]

[Biochimie] Enzyme de restriction

-celle qui vont couper en cohesive ends et laisser à chaque fragment un morceau d'ADN monocaténaire. de retour à l'exemple, disons que l'enzyme coupe entre le G et le C en position 1 et 2. On marque normalement ça comme ça. 3'-G. CATGC-5'.  [...] Je dirais plutôt que l'enzyme de restriction va cliver à l'intérieur de cette séquence et générer ainsi 2 fragments soit à bouts francs soit cohésifs. Elle peut cliver en plein milieu ou après un nucléotide ou trois nucléotides, tout dépend de l'enzyme.  [...]

Sequence 5' pour un ADNc en Southern Blot

j'explique si la deuxiéme sonde utilisée est marqué à son extrémité 5' et puisqu'elle s'hybride avec le fragment 1.1 adnc et 4.1 dans l'adng.....je pense que la séquence du fragment 1.1 est comprise dans le frg 4.1 et donc ce dernier contient une partie exonique de 1.  [...] Je mettrais juste une précision. Rien ne prouve que ce fragment de 4.1 ne contient qu'un exon, ni qu'il contient uniquement la partie exonique reprise dans le fragment 1.1. Cela dépend de la sonde choisie.  [...]

[bio mol] hélicase

je pensai mettre en presence tout les composant de la réplication (classique de E. Coli..on vas pas compliquer...) ADN, dNTP(marqué pour réperer une éventuel réplication), primase, ADN poly, ligase, SSB.  [...] Tu synthetises un fragment double brin d'ADN marqué radioactivement. Tu fait agir ton helicase (qui probablement n'a pas besoin des autres protéines du complexe de replication pour agir) et tu deposes le produit de la reaction sur un gel de polyacrylamide.  [...]

A quoi sert une électrophorèse ?

Les marqueurs servent à évaluer le poids de ton fragment d'ADN qui migre. si tu as un marqueur à 100 pb et que ton ADN a migré au même niveau que les marqueurs (bande des marqueurs et de ton ADN sont côte à côte), ça veut dire que ton fragment d'ADN fait aussi 100 pb (car les molécules migrent en fonction de leur taille).  [...] Aussi, on parle aussi de fragments d'ADN, quand l'ADN migre et qu'il y a plusieurs barres, c'est que ces fragments ont tous migrés indépendamment des uns des autres.  [...]

[Génétique] hybridation adn/adn : technique de southern blot

Mon ADN lambda à un poids moléculaire de 48 502 pb. Et le premier fragment de mon marqueur correspond à 21 226 pb. Or en regardant mon gel, je constate que mon ADN lambda( puit n°4) à migré au meme niveau que le premier fragment du marqueur. comment peut- on expliquer cela puisqu'ils n'ont pas le même poids moléculaire.  [...] Donc dans ce cas, le fragment d'ADN visible au puit 4 à déjà été digéré. puisqu'en regardant ma carte de restriction, je constate que EcoRI permet d'obtenir un fragment de 21 226 pb. Pourtant mon puit 4 ne contient pas d'enzyme, donc pas de digestion possible.  [...]

[Biochimie] PCR & Southern Blot

PCR et Southern ne sont pas utiliser dans le même but mais ils peuvent être fait de façon complémentaire. Pour ce qui est de la révélation lors du southern effectivement la sonde doit être marqué (pas obligatoirement par radioactivité d'ailleurs). Pour la PCR les fragment amplifié sont visualiser après migration sur gel d'agarose contenant du BET (bromure d'ethidium), c'est une molecule qui s'intercale entre les base de l'ADN qui devient fluorescent sous UV.  [...] Si, si tu le fais migrer en même temps qu'un marqueur de poids moléculaire = mélange de fragments d'ADN de taille connue (cela peut être un ADN de ta collection digéré par des enzymes à ta convenance).  [...]

[Biologie Moléculaire] ARN antisens à partir d'un fragment de gène

1) on fait une sonde ARN sens via une transcription localisée sur le fragment, à partir du brin matriciel non codant mais transcrit (pour peu qu'on arrive à limiter la transcription au fragment et pas au delà en aval).  [...] 2) on utilise une ARN polymérase sur la sonde sens néosynthétisée, en présence de dATP, dGTP, dUTP et dCTP* radioactif, pour synthétiser un brin anti sens complémentaire au brin arn sens, donc identique au brin non codant d'ADN (mais avec U au lieu de T), donc complémentaire au fragment ADN (et le brin anti sens sera marqué radioactivement via dCTP*).  [...]