• Forum - ADN, Domaine, Acide

Notion de récepteur chimère

Cette notion a été abordé par mon prof quand il nous parlait du virus de l'hépatite B. L'ADN viral s'intégrerait dans le domaine C du récepteur à l'acide rétinoïque (sachant que le domaine C est le domaine de liaison à l'ADN contenue dans le noyau de la cellule), ce qui entraînerait une sur-expression de récepteur chimère.  [...] Je ne suis pas certain de ma réponse mais à mon avis il voulait simplement souligner que sur ce récepteur il y à la fois des éléments de la cellule hôte (le récepteur en lui même) et des éléments du virus (adn viral associé à ce récepteur), d'où le terme de chimère.  [...]

[Vignettes cliniques] Approche systémique de la physiopathologie pour les étudiants en Médecine

Chaque récepteur possède un site de liaison à l'ADN (souvent en doigt de zinc), un site de liaison pour les hormones thyroïdiennes, et un domaine A/B de régulation transcriptionnelle. Les récepteurs TR se lient à l'ADN sous forme d'homodimère ou d'hétérodimère (notamment via le récepteur de l'acide rétinoïque X, RXR).  [...] La protéolyse musculaire est augmentée si le patient ne compense pas l'augmentation de son métabolisme par un régime plus riche en calories. les acides aminés glucoformateurs sont alors recrutés, notamment l'alanine et le glutamate, à partir des protéines musculaires pour la gluconéogenèse.  [...]

[Divers] [biologie du developpement] développement des membres

TBX. protéines portant le domaine T (T-Box). Il s'agit d'un domaine de 180 acides aminés se fixant sur la moitié d'un domaine palindromique.(5'-AATTTCACACCT AGGTGTGAAATT-3'). Le mode de fixation est original en plusieurs aspects. Le premier est qu'il intéresse le grand et le petit sillon de l'ADN.  [...] TBX. protéines portant le domaine T (T-Box). Il s'agit d'un domaine de 180 acides aminés se fixant sur la moitié d'un domaine palindromique.(5'-AATTTCACACCT AGGTGTGAAATT-3').  [...]

[Biochimie] acides aminés

la titration d'un acide aminé acide montre 3 domaines. 1domaine acide, 1domaine neutre et 1 domaine basique. vrai ou faux.  [...] Dans ce cas, il s'agit de la courbe de titration d'un acide aminé à chaîne latérale ionisable soit trois fonctions ionisables en tout donc trois phases puisque trois sauts de pH.  [...]

[Biologie Moléculaire] Dégradation de la cycline D1

Pour le double hybride, on fusionne l'ADNc de la cycline D avec le domaine de transactivation de GAL4, et en parallèle on fusionne les ADNc des ubiquitine ligase connues avec le domaine de liaison à l'ADN de GAL4. Les deux vecteurs sont transfectés dans des levures avec un gène rapporteur sous contrôle d'un promoteur contenant l'élément de réponse de GAL4.  [...] Si la cycline D interagit avec une ubiquitine ligase, cette interaction rapproche le domaine de liaison à l'ADN de GAL4 avec son domaine de transactivation et cela active l'expression du gène rapporteur qu'on peut visualiser (levures bleues si le gène rapporteur code la beta-galactosidase).  [...]

technique du double hybride

Le principe repose sur l'utilisation d'un facteur de transcription avec deux domaines, un domaine de liaison à l'ADN et un domaine de transactivation.  [...] En utilisant une séquence d'ADN codant pour un gène rapporteur sous le controle d'un promoteur activé par le facteur de transcription, on peut fixer la cible sur l'ADN via le domaine de liaison de l'ADN du facteur de transcription. Comme le système ne possède pas le domaine de transactivation, il n'y a pas d'activation de l'expression du gène.  [...]

Fonction "DNA binding"

L'homéodomaine correspond à une partie d'une protéine qui se fixe à l'ADN. Ainsi, l'homéobox d'un gène correspondra à ce domaine de fixation à l'ADN.  [...] D'accord, merci Mais du coup, il existe un homéodomaine pour toutes les protéines ou seulement pour celles qui agissent sur l'ADN.  [...]

[Biologie Moléculaire] Mode d'action des facteurs de transcription

Sans trop rentrer dans les détails, les facteurs de transcription sont capable de se fixer sur des zones spécifiques d'un promoteur d'un gène donné et d'aider la RNA pol a se fixer indirectement ou directement pour transcrire le gène.   [...] Petite précision, la fixation à l'ADN de fait par des domaines particuliers. Il y a différents domaines connus, par exemple doigt de zinc.  [...]

[Biologie Moléculaire] Expression de protéines grâce au pGEX. DH5alpha ou BL21?

J'ai une autre question pour ceux qui ont un peu d'expérience. Jusqu'ici j'ai utilisé un clone qui s'avère produire une protéine avec un acide aminé différent par rapport à la séquence de référence MGI. Ma protéine est hyper conservée dans l'évolution et cet acide aminé modifié se trouve au milieu d'un domaine totalement conservé.  [...] Je suis en train d'analyser de nouveaux clones pour avoir la protéine parfaite. Cependant ma question est. est ce que c'est réellement grave quand on diverge d'un acide aminé dans un domaine conservé Est ce que vous utilisez toujours des clones codant pour des protéines parfaites pas Au contraire, avez vous eu des expériences malheureuses à cause d'une mutation.  [...]

[Biologie Moléculaire] P53 et réparation de l'ADN

La protéine s'organise autour d'un domaine central hydrophobe (résidus 110 à 290), qui se lie à des séquences d'ADN spécifiques (contenant des répétitions du motif RRRCA/TA/TGYYY). Deux des cibles majeures de p53 sont p21waf-1, un inhibiteur de kinases cycline-dépendantes impliqué dans l'arrêt du cycle cellulaire en G1, et Bax-1, un inhibiteur de bcl-2 impliqué dans le contrôle de l'apoptose.  [...] La partie aminoterminale (résidus 1 à 42) contient un domaine de transactivation, nécessaire pour induire l'initiation de la transcription des gènes dont les promoteurs contiennent des séquences qui lient p53. La portion postérieure (résidus 330-360) permet l'agrégation de p53 sous forme de tétramères, et l'extrémité carboxyterminale (résidus 360-393) renferme un domaine de régulation négative dont l'effet inhibiteur doit être levé pour permettre à p53 de lier l'ADN avec haute affinité.  [...]