• Forum - ADN, Bactéries, But

[Biologie Moléculaire] l'hybridation ADN/ADN "les différent méthodes???"

j'ai un recherche sur les différent méthode de determiner l'homologie d'un ADN de 2 bactéries pour le but de les classifer (taxonomie phylognétique).  [...] Par contre si tu ne sais pas quelles bactéries tu as dans ta petite boite, ben il va falloir commencer par des recherches du séquencage et encore de la bioinfo.  [...]

[Biologie Moléculaire] Epidémie de diarrhées (tp)

Bonjour, je suis en L1 biologie et j'ai des questions à propos d'un test moléculaire fait en cours sur les souches des bactéries causant la diarrhée. Nous avons vu que la plupart du temps elle est due aux gènes invasive et adhésine. Nous avons réalisé une électrophorèse des plasmides des malades, nous savons qu'il y a deux souches différentes de bactéries causant la diarrhée et notre but est de savoir si la diarrhée étudiée est causée par l'invasine et l'adhésine en comparant la tailles des fragments d ADN qui ont migré avec la carte de restriction de l'invasine et adhésine.  [...] Le problème est qu'en essayant de comparer les fragments de références avec ceux de l'expérience je ne trouve pas qu'ils font la même taille de paire de base.   [...]

aide pour un protocole (PCR, DGGE...)

Tu fais ce qu'on apelle de la métagénomique c'est à dire que tu étudies les bactéries d'un environnement particulier (ici c'est de la terre). Le but est d'extraire l'ADN total de ce biotope pour rechercher des nouveaux gènes qui permettraient à la bactérie dexploiter le black carbon.  [...] On extrait donc l'ADN total du sol, on amplifie la région de l'ARN 16S avec des amorces universelles. Puis le produit PCR est analysé par électrophorèse. Pour identifier les bactéries on utilise l'ARN 16S parce que cette région est très conservée en raison de son rôle dans la synthèse des protéines.  [...]

Apparition de l'ADN

En plus j'en connais qu'en même pas mal en biologie.. simplement je ne retient souvent que l'essentiel des choses... je sais par exemple que les bactéries s'échange des bruns d'ADN pour se refiler des trucs chimiques afin de se protéger.. ça rend mon scénario super probable.  [...] En outre, on peut difficilement considérer qu'une bactérie est décider de faire un noyau... par qu'il aurait fallu qu'il soit directement un noyau complexe mais on peut imaginer qu'une espèce ai évoluer vers l'encapsulation de l'ADN, (ce qui revient à dire qu'elle ont décidé, si on considére que l'évolution de l'ADN représente l'évolution culturelle de la colonie (logique puisque les bactéries s'échange l'ADN (ou ARN bien sur) durant leur vie) dans un but non propre à elle, mais dans le cadre d'une communication.  [...]

Détection bactériennes

Est-ce que quelqu'un connait bien la problématique des contaminations bactérienne dans les PCR ( ou autres ) et qu'elle type de sensibilité je peu espérer si mon but est la mise en évidence des bactéries.  [...] une bactérie par millilitre c'est très peu. Avec toutes les méthodes connues tu vas être dans le bruit de fond. La PCR par exemple amplifie toujours quelque-chose dans les témoins négatifs. Il y a de l'ADN bactérien dans la taq, c'est connu et publié. Il te faudrait concentrer tes échantillons.  [...]

Technique de lyse

Mon but est de faire une lyse bactérienne afin d'extraire l'ADN.  [...] tu veut lyser quel genre de bacterie (gram + ou -) et de quel milieu (culture, terre...) et effectivement la sonication c'est pas terrible pour l'integrité de ton ADN.  [...]

[Génétique] Incompréhension transcription inverse

Le but est par exemple de produire une protéine recombinante. l'ADNc peut être transcrit et traduit dans un autre organisme, comme une bactérie, alors que l'ADN ne pourrait pas (en raison des introns justement).  [...] D'accord merci. Mais il y a quelques choses que je ne comprends pas, l'ARN messager (ARNm) quand il est transcrit dans le processus normal par une ARN polymérase, avant l'épissage on dit que c'est un ARN pré-messager c'est à dire qu'il a toujours des séquences régulatrices c'est à dire des introns et que suite à l'épissage il devient ARN messager (ARNm) donc il ne possède plus de séquence régulatrice donc d'intron, le problème c'est que dans la définition d'ADNc on dit que c'est de l'ADN formé par une ADN polymérase ARN dépendant et qu'elle permet d'avoir une ADNc donc, dépourvue d'intron (séquence régulatrice) mais normalement l'ARNm ne possède pas d'intron.  [...]

génie génétique

Pour répondre à la question initiale. On réalise d'abord des cultures de bactéries présentant des séquences palindromiques (je ne sais pas l'écrire) genre. GCTGAT ou un autre bien sur, mais qui soient complémentaires (l'image du tétris citée me plait assez) du gène à insérer de tes deux bouts.  [...] Le but c'est vaguement de couper ton adn circulaire de bactérie à un (ou plusieurs) endroits mais pour faire simple on prendra 1 seul (dans les cas compliqués tu as un truc comme ceci images[5].jpg.  [...]

Système de restriction modification (RM) Bactérie - Phage

On m'explique que le système RM a deux fonctions restrictions et modifications et que ce système a pour but de couper l'ADN phagique qui est injecté dans une bactérie. Jusque là ca va j'ai compris. =).  [...] Ensuite j'ai ce schéma que j'ai du mal à comprendre, car je vois que l'ADN est méthylé et qu'après l'endonucléase ne se fait pas, et donc du coup le phage va pouvoir se multiplier et refaire d'autre phage. J'en ai conclu que le fait que l'ADN phagique soit méthylé, la bactérie ne le reconnait pas comme étranger et donc du coup l'endonucléase ne se fait pas.  [...]

[Microbiologie] bactériophages ARN F spécifique

Lors de mes titrages, je prépare un milieu sans Rnase, et un avec Rnase. Sachant que le but est de comparer à la fin, combien j'ai des bactériophages à ARN dans mon échantillon. (et non à ADN).  [...] Par conséquent je fais la différence entre les bactériophages totaux, et les bactériophages à ADN ( vu que j'utilise la Rnase qui va inactiver tous les phages à ARN).  [...]