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[Microbiologie] Identification des bactéries

Par contre, nous ne savons pas quelle espèce de Chromohalobacter nous avons entre C. israelensis, C.salexigen ou C.marismortui.  [...] Je commencerais par regarder la littérature, et d'abord les publis où ces espèces ont été décrites. S'il n'y est pas question de génétique (si c'est des publis anciennes), je chercherais sur les bases de données des séquences de ces espèces et essaierais de les blaster pour voir un peu qui s'aligne avec quoi.  [...]

sequencage du genome humain

Hmm... je comprend bien que globalement nous sommes tous identique, mais pour bosser chez des bacteries, je sais que 2 bacteries de la meme especes n'ont pas forcement la meme organisation genetique, les genes sont deplacés (ce qui pose vachement de probleme).  [...] Les bactéries de la meme espece peuvent en effet ne pas présenté le meme patron génétique à cause notament de la transformation via le facteur K, mais elles ont globalement les mêmes gènes. Sinon on ne parle plus de la même espece. En plus les bactéries possédent de l'ADN extrachromosique qui fait qu'une bactérie peut posséder des propriétés que d'autres souches de la même espece ne possédent pas.  [...]

[Microbiologie] Réponses au stress et système SOS

D'oh. Non merci, je ne suis pas spécialiste pour un sous. Alors désolé si je te choques mais en résumé. s'il y a un dimère de thymine ( une mutation ) alors il y a un système de correction qui se met en place. Mais c'est quoi sa fonction Réparer l'ADN oui, quel avantrage en tire la bactérie Un peu de nouveauté dans un monde de reproduction asexuée, ça ne ferait pas de mal à l'espece, non.  [...] Alors désolé si je te choques mais en résumé. s'il y a un dimère de thymine ( une mutation ) alors il y a un système de correction qui se met en place. Mais c'est quoi sa fonction Réparer l'ADN oui, quel avantrage en tire la bactérie Un peu de nouveauté dans un monde de reproduction asexuée, ça ne ferait pas de mal à l'espece, non.  [...]

[Microbiologie] Transfert de gènes par conjugaison/transformation

Dans la transformation l'ADN n'est pas échangé entre deux bactéries comme dans la conjugaison mais introduit à partir du milieu extérieur dans une bactérie réceptrice.  [...] L'ADN transformant et l'ADN de la bactérie réceptrice doivent être similaires et la transformation n'est possible qu'entre bactéries d'une même espèce ou qu'entre bactéries appartenant à des espèces voisines.  [...]

[Biotechnologie] Isolé un gène d'une bactérie thermophile inconnue

si tu travailles a partir d'une espece dont le génome n'est pas connue. Tu prends des especes proches, tu alignes les polymérases et définis des motifs les plus conservés possibles et les plus spécifiques possibles de ton enzyme. Tu dessines des amorces dégénérées (prenant en compte la dégénérescence du code génétique) et tu fais une PCR.  [...] thermophile... mais à 42°C c'est pas hyper chaud... et puis E. coli va se contenter de répliquer l'ADN archéen, en se fichant pas mal de savoir ce qu'il code. elle a tout ce qu'il faut pour se développer, et ne va pas s'embêter à synthétiser une autre polymérase, qui ne marcherait sans doute pas dans une bactérie si éloignée phylogénétiquement. Il me semble, en tout cas.  [...]

Enzymes de restriction

Parce que l'ADN de la bactérie est méthylée au niveau de certaines séquences bien spécifiques (plus particulièrement sur les adénines et les cytosines), ce qui permet aux enzymes de restriction de reconnaître l'ADN bactérien et donc de ne pas le couper.  [...] C'est l'emplacement de la méthylation qui change d'une espèce à l'autre et qui permet à l'enzyme de restriction de reconnaître l'ADN de la bactérie qui la (. -l'enzyme de restriction) synthétise.  [...]

Les bactériophages ??

Est ce qu'un bactériophage qui infecte une bactérie créer une nouvelle espéce de bactérie Etant donner que certain bactériophage s'intégre dans le génome bactérien.  [...] Soit le phage a un cycle lytique (lyse de la bactérie lors de la production de particules virales), soit il a un cycle lysogénique (ou tempéré) (incorporation de l'ADN phagique dans l'ADN bactérien, mais cet ajout n'est pas suffisant pour donner une nouvelle espèce, en attendant d'entamer un cycle lytique) - je fais simple.  [...]

TP biochimie: introduction aux méthodes utilisées en génie génétique

Après je ne sais pas si c'est possible mais tu pourrais peut-être fragmenter ton plasmide, l'injecter dans l'environnement. ensuite tu rend tes bactérie transformante c'est un état où les bactéries sont capable d'incorporer de l'ADN provenant de l'environnement.  [...] Donc à partir de là tu peux calculer les différents fragments obtenus après clivage de l'enzyme. De plus tu as des fragments de taille différente notamment un ADN linéarisé je pense que c'est peut-être aussi pour voir quel taille d'ADN exogène est capable d'incorporer une bactérie transformante.  [...]

[Microbiologie] Virus ou Bactéries, j'ai du mal à me décider !

Fenkys, ta solution d'un cocktail de bactéries pour cibler un maximum d'espèce me semble plus compliquée qu'une seule bactérie qui cible l'ADN de toute les espèces (en fait quelle espèce n'en a pas - c'est une question, je croyais que tous les animaux en avait.  [...] J'aime bien en tout l'idée d'un cocktail de bactérie toute la même espèce qui produirait un cocktail de toxines suffisament nouvelle et puissante pour tout tuer.  [...]

[Biologie Cellulaire] transfert des gènes de résistances

Transformation bactérienne. Une bactérie meurt, son ADN est relarguer dans le milieu et une autre bactérie adsorbe cette ADN puis l'intégre a son génome. ADN portant potentiellement de tel génes de résistances.  [...] Transduction. Un phage s'excise mal et emporte un morceaux du chromosome de la bactérie dans lequel il était intégrer. Morceaux pouvant comporter un géne de résistance. Puis ce phage va infecter une autre bactérie et cette bactérie intégre l'ADN du virus au sien et devient ainsi résistante.  [...]