• Forum - Acides aminés, TER, Protéines

peptide signal et ribosomes libres

Sinon Yoyo, pour ta question sur les protéines résidentes dans le RE, elles possèdent ce que l'on apelle une séquence de rétention dans le RE qui est (il me semble mais je n'ai aucun bouquin sous la main pour vérifier) une séquence de 4 acides aminés en Nt je crois.  [...] Les protéines nucléaires sont effectivement traduites dans le cytosol. Elles portent en C-ter une courte séquence d'acides-aminés chargés positivement appelée signal de localisation nucléaire ou SLN bien qu'on la croise plus souvent sous sa dénomination anglaise NLS.  [...]

[Biochimie] Question sur le reactif de sanger

(ou le 2.4DNFB) coupait les acides aminés du coté N-ter des protéines et qu'ils devenaient des DNP.  [...] Et donc quand un acide aminé est marqué par ce DNP, on est sur que celui ci était le tout premier acide aminé du peptide séquencer Le premier en N-ter.  [...]

Acylation / Farnésylation / Prénylation

Acylation = modification de protéines par fixation covalente d'un ou plusieurs acides gras via une reaction d'acylation ( = formation d'un lien ester, amide ou thioe s ter).  [...] L'acylation de certains protéines G monomériques (Ras, Rho...) est indispensable à leur activité fonctionnelle. Plusieurs d'entre elles se terminent par la séquence consensus de prénylation CaaX sur laquelle est fixée le résidu d'acide gras isoprénoïde. Les inhibiteurs de la farnésyl-transférase sont utilisés en cancérologie pour bloquer la farnésylation de Ras.  [...]

[Immunologie] Anticorps

Dans les tests immunologiques de type ELISA, afin d'être sûr que l'anticorps va bien se fixer à l'antigène, on cache la surface des puits avec la protéine de BSA par exemple. Peut-on dire que la protéine de BSA a une plus grande affinité pour le fragment Fc que pour la CDR (site de reconnaissance) de l'anticorps Et si oui, pourquoi.  [...] Dans le cas de l'immunofluorescence, le gutaraldéhyde est utilisé pour créer des ponts covalents entre les groupements aminés libres des protéines, la molécule de fluorochrome va donc se fixer au fragment Fc et non à la partie qui reconnait l'antigène. Comment la glutaraldéhyde peut créer des ponts covalents alors que le fragment cristallisable se trouve du côté C-ter (Ça rejoint un peu la première question).  [...]

[Biologie Cellulaire] Protéines de type 1 ou 2

Je n'ai pas trés bien compris comment se mettaient en place les protéines de type 2. Est-ce que ça ne concerne que les protéines du RE.  [...] C'est lorsque l'extrémité C-ter est extra-cellulaire contrairement aux protéines de type 1, qui ont leur extrémité C-ter dans le cytosol.  [...]

[Divers] Des questions sur des protéines :o)

Voilà que la Malicia a décidé (il y a précisément 17 min 35 sec 26 ) de se lancer dans l'introduction de son rapport de stage... Chose dite, chose faite, mais voilà que le premier papier que je reprends me fait me poser quelques questions que je vous soumets, dans le cas contraire je risque le somnambulisme aigu Je traite des protéines STAND (Signal Transduction ATPases with Numerous Domains) et plus particulièrement de deux protéines de la sous-classe ASCE, l'une bactérienne (facteur de transcription) et l'autre humaine (impliquée dans la réponse innée à des infections bactériennes).  [...] Oki doki, merci En fait, il s'agit d'une protéine avec une structure totalement prédictionnelle avec un domain putatif en C-ter au sein duquel il y aurait cette structure putative Je me disais bien que j'aimais pas les protéines.  [...]

[Biologie Moléculaire] structure des protéines

Une expérience de synthèse protéique in vitro a été réalisée en 1977 à partir d'ARNm extraits de pancréas de boeuf. Las ARNm sont ajoutés en présence d'acides aminés radioactifs.  [...] a/ je suppose que les ARNm, en présence des acides aminés, vont synthétiser une protéine Mais il ne manque pas quelque chose pour que la protéine puisse être synthétisée, comme de l'ARN ribosomique par exemple.  [...]

[Biochimie] Methode sanger

Hello. Je suis en terminal mais j ai un test dans une prépa médecine mercredi... On a eu un polycopié à apprendre sur les peptides mais je ne comprends pas les annotations utilisées dans la partie sur la méthode Sanger (par rapport à la détermination de la séquence peptidique).   [...] J imagine que AA signifie acide aminé, mais pk (AA) n-1 N-ter c est l aa du côté gauche conventionnellement, celui collé avec le groupe amine non engagé dans une liaison peptidique... Mais je ne comprends pas les DNP, AA1, DFB.  [...]

[Biochimie] Methode sanger

Un passage parle de la methode sanger pour la détermination de la séquence peptidique. On a juste un schéma avec pleins d abréviations et je ne comprends pas la signification de toutes ces abréviations... Donc toute aide serait la bienvenue.   [...] Je pense que celui en N-ter désigne l'acide aminé du côté amine (à gauche conventionnellement). J imagine que AA signifie acide aminé mais que désigne le n Le DNP-AA1 le DFB Le HF.  [...]

[Biochimie] Structures 3D et couleurs froides et chaudes

Lors de la représentation 3D d'une protéine, je ne me souviens plus si les couleurs chaudes indiquent le N-ter et les couleurs froides le C-ter ou inversement.  [...] Et malgré une recherche rapide, je ne parvient pas à retrouver l'information.   [...]