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[Biochimie] Acides aminés au site catalytique d'un enzyme

J'aurais une petite question concernant les enzymes se retrouvant au site catalytique d'une enzyme qui est spécifique aux substrats basiques.  [...] Les acides aminés se retrouvant au site catalytique de l'enzyme seraient donc, de façon théorique, des acides aminés acides, qui portent une charge négative à pH 7, par exemple l'aspartate.  [...]

[Biologie Moléculaire] Enzymes de restriction VS fragment d'ADN

Explication. après avoir amplifié mon insert par PCR, je le digère d'un côté avec une enzyme qui donne des extrémités cohésives (BglII pour ne pas la citer). Seulement, le site de reconnaissance est lui-même à l'extrémité de mon insert (car je l'ai ajouté artificiellement grâce à mes primers), si bien que le site n'est flanqué que de 2 paires de bases seulement d'un côté, et de tout le reste de mon insert de l'autre.  [...] une seule clef ira dans une seule serrure (en oubliant les passe-partout pour l'exemple bien entendu ). La reconnaissance du site par l'enzyme induit un changement conformationnel de l'enzyme qui va approcher les acides aminés du site catalytique à proximité du site de clivage.  [...]

Ph et activité enzymatique

Bonjour à tous, Je me demandais comment le faite de s'éloigner du Ph ou de la température optimale pour lesquels une enzyme est la plus fonctionnelle agirait sur les acides aminés du site actif Je sais qu'au delà, elle perd progressivement sa fonction catalytique jusqu'à se retrouver dénaturée ( voir inactive ) mais je ne fais pas le lien avec l'interaction sur les acides aminés.  [...] Pour prendre un exemple, une enzyme avec un site actif à cystéine n'est fonctionnel que si la cystéine est sous forme thiolate (S-), donc si tu augmente la concentration en proton (en diminuant le pH), tu va petit à petit réduire la totalité des cystéines sous forme de thiol (SH) qui seront incapable de réagir avec le substrat.  [...]

Besoin d'un peu d'aide : enzymes et acides aminés

Bonjour, cela est du à la conformation de l'enzyme, son site actif n'est accessible et actif qu'à pH acide. Le changement de pH induit un changement de conformation. Quant aux acides aminés impliqués, il s'agit souvent d'un acide aspartique.  [...] La structure primaire c'est la composition en acides aminés, l'ordre dans lequel ils sont disposés. Une fois synthétisées, ces longues chaines d'acides aminés ne restent pas linéaire mais se replient en boules. La manière dont elle se replient est très spécifique et est généralement due à la présence de certains acides aminés.  [...]

[Biologie Cellulaire] Principe d'émergence - Acides Aminés et Enzyme

=. d'où assemblage des acides aminés formant les protéines (et on pourrait même partir de combinaisons des acides nucléiques =. ADN...etc) =. enzymes =. caractéristiques de l'individu dans son ensemble.  [...] Je cherchais un exemple concret de deux protéines contenant les mêmes acides aminés mais dont les fonctions diffèrent. Je cherche encore.  [...]

[Biochimie] pH Optimum des enzymes

Pour qu'une enzyme donnée soit active, il faut un certain pH du milieu. Ce pH va induire la ionisation (ou non) de certains acides aminés qui composent cette enzyme, et donc activer (ou non) l'enzyme.  [...] Cela dit, acide aminé ionisé ne veut pas forcément dire enzyme active. L'activation de l'enzyme peut aussi être dépendante de la non-ionisation de certains acides aminés.  [...]

Le scénario de l'origine de la vie enfin déterminé ? - Page 2

Living cells are able to harvest energy by coupling exergonic electron transfer between reducing and oxidising substrates to the generation of chemiosmotic potential. Whereas a wide variety of redox substrates are exploited by prokaryotes resulting in very diverse layouts of electron transfer chains, the ensemble of molecular architectures of enzymes and redox cofactors employed to construct these systems is stunningly small and uniform.  [...] Pourquoi toutes les protéines actuelles sont faites avec des acides aminés L Simplement parce que le site actif en trois dimensions du ribosome ne reconnaît que les acides aminés L. S'il devait traiter des acides aminés D, il ne les reconnaîtrait pas.  [...]

[Biologie Moléculaire] Site actif d'un enzyme.

Il faut imaginer l'enzyme, protéine donc, comme une boule de ficelle(une ficelle d'acides aminés). Cette boule a comme une serrure, un creux.  [...] L'activité de l'enzyme dépend de la forme et de la taille de la serrure et aussi des acides aminés au fond. Les acides aminés ont des groupements chimiques différents au niveau de leur chaine latérale. C'est la chaine latérale qui différencie les acides aminés en fait.  [...]

[Biochimie] Phosphorylation des acides aminés

L'enzyme hépatique active est sous la forme d'un tétramère. La partie N-terminale, en particulier un peptide composé de 6 acides aminés, joue un rôle important dans l'interaction entre les sous unités. La phosphorylation d'un de ces acides aminés modifie l'affinité de l'enzyme pour le phospho-énol-pyruvate.  [...] En fait c'est un QCM, et l'une des proposition était la phosphorylation est une régulation covalente de l'enzyme, je n'ai pas très bien compris ce que le prof a voulu dire par régulation covalente de l'enzyme.  [...]

[Biochimie] Exo svt 1ère S

jai fais le 1er exo mais je sais pas si cest juste mais la cest le 2em qui est assez urgent et la je bloque vraiment en fait je ne comrpends pas sous quel forme je dois donner la reponse je pense quecest comme dans le 1er en disant l nom de chaque acide aminé mais je ne trouve aucun acide aminé qui commence comme dans mon exo je ne demande pas la reponse mais juste une petite explication un peu plus precise.  [...] 1° identifie les 6 résidus de tes 2 peptides (à l'aide du site http.//www.snv.jussieu.fr/vie/dossie...acideamine.htm ). Tu as tout sur ce site, le code à 3 lettres des acides aminés et les structures des acides aminés.  [...]