• Forum - Acide aminé, Particulier, Séquençage

Réaction d'Edman

J'aurai une petite question par rapport à la réaction d'Edman et la proline. Etant un acide aminé un peu particulier y a t-il des probleme pour le sequencage ou un traitement particulier.  [...] Il ne me semble pas. le seul acide aminé que je sais poser probleme est la cysteine.  [...]

[Biochimie] séquençage d'une proteine

De cette façon, on ne séquence pas de façon séquentielle (acide aminé par acide aminé). Le séquençage n'est possible que si la fragmentation génère assez de fragments différents.  [...] Ensuite, il est possible de séquencer ta protéine de façon séquentielle grâce à la méthode d'Edman que j'ai citée avant. Cette méthode va dégrader ta protéine acide aminé par acide aminé. Le produit de la dégradation est analysé et tu peux ainsi déterminer ta séquence d'acides aminés.  [...]

[Biochimie] Diverse question

Des méthodes de séquençage d'acide aminé, laquelle est la plus utilisée, et pourquoi j'ai mis que c'est la méthode d'edman car la protéine reste intact.  [...] D'ailleurs à cette question, la réponse n'est pas évidente car cela dépend du vocabulaire utilisé. On préfère parler d'une fonction (qui peut être une enzyme par exemple) portée par deux protéines différentes, par conséquent on parle d'un hétérodimère. Mais parler d'une protéine hétérodimérique est pour moi un non sens.  [...]

dégradation de protéine recombinante

Quelque chose de possible aussi, c'est qu'une bonne partie des produits de dégradation soient instables en solution et qu'ils aient tendance à s'aggréger. Dans ce cas, si tu as accès à une ultracentrifugeuse, tu déposes ta protéine sur un coussin de sucrose 20%, tu centrifuges 1 heures à 100000 g, ta protéine reste au-dessus et les contaminants aggrégés vont traverser le coussin.  [...] Si tu veux vraiment le savoir, le mieux est de faire du sequencage N-terminal, mais c'est assez cher (50 euros l'acide aminé de memoire et il t'en faut 4 ou 5 pour etre sur).  [...]

[Biochimie] Poids plus élévé après digestion enzymatique

J'ai envoyé mon fragment à séquencer et il s'avére qu'il est juste. Je ne sais toujours pas pourquoi sur le gel il m'aparait comme ayant 200 pb de plus mais bon il est correct.  [...] J'aurais encore une petite question si cela ne vous embête pas trop. Suite au séquençage de mon ADN, j'ai constaté qu'il y avait une mutation de Asn en Asp. Ces deux acides aminés presente une chaine de la meme longueur, ils peuvent les deux faires des liaisons H par contre il y en a un qui est neutre et l'autre acide.  [...]

révolution de la dernière décénie

je passe un concours pour entrer à l'INRA et dans les annales, je trouve la question [I]selon vous, quelle avancée technologique appliquée à l'étude du vivant vous a particulièrement interessé au cours des 10 dernières années expliquée les raisons.  [...] Alors bien sur il y a la reponse classique mais neanmoins majeure. le sequencage des genomes, en particulier celui de l'homme.  [...]

[Evolution] Que veut dire "plus évolué" ?

Ce qui me fait également penser à une autre question qui me traverse l'esprit. qu'est ce que le génome humain Est-ce l'ensemble génétique commun à tous les homo sapiens ou est-ce le génome d'un humain particulier (lequel ). Je pense en particulier au séquençage.  [...] Si la séquence humaine est significativement plus proche de la séquence macaque que la séquence chimpanzé, on peut dire que l'évolution a été plus rapide chez le chimpanzé. Mais il faut regarder gène par gène. Je ne sais pas si on peut tirer ce genre de conclusion à l'échelle du génome entier.  [...]

[Biologie Moléculaire] Problème de séquençage - Page 2

Oui et Non, oui parceque finallement le séquençage du pseudonoeud ne pose aucun probleme maintenant je ne sais pas trop pourquoi mais mon probleme etait lié a un clone tres particulier.  [...] Donc oui mon probleme est résolu car j'arrive a séquencer de maniere standard, mais non car je ne sais toujours pas ce qui posait probleme.  [...]

[Biotechnologie] Global Analysis of Protein Activities using proteome chips

Il existe deux façon de séquencées les protéines. le séquençage réel des acides aminés ou le séquençage d'adn du gène correspondant. Nous somme bien dans le dernier cas.  [...] Si tu as une protéine complètement inconnu, et pas son ADN, il faudra séquencer les acides aminés de la protéine un à un (en tout cas, le début de la protéine), avant de pouvoir trouver la séquence ADN.  [...]

[Biochimie] Est-il possible de réaliser le séquençage des acides aminés impliqués dans des interactions

Je voulais savoir si il était possible de séquencer les acides aminés de la protéine qui peuvent interagir avec l'héparine.  [...] On pourrait récupérer cette fraction, la caractériser par spectro de masse, et, connaissant la séquence de la protéine et donc les sites de coupure enzymatiques, déterminer la séquence du fragment en question.  [...]