• Forum - Acide aminé, Configuration, Beta

[biochimie] acides aminés et feuillet beta

Je me tourne vers vous car je n'arrive pas à voir pourquoi et/ou comment l'intégration d'un acide aminé configuration D dans un feuillet beta va le défaire.  [...] Quoique je dis une bêtise pour l'alignement parallèle. ça plie carrément dans l'autre sens à cause de l'encombrement stérique du carbone configuré D. Donc c'est même pire.  [...]

[Biochimie] Construire Une Protéine par chance

Comment puis-je calculer la probabilité q'une protéine quelconque se forme par chance si on a mis tous les 500 acides aminés q'on connait dans la nature dans un mélange sachant que seulement 140 parmi ces acides aminés sont présents dans les protéines et aussi sachant que chaque acide aminé peut être soit L ou D et on doit seulement avoir la configuration L.  [...] Ce qui veut dire qu'à l'origine, il faut imaginer de petites chaînes d'acides aminés (probablement moins de 10 résidus), avec une forte concentration en glycine (achirale) et en alanine (D et L).  [...]

combinaison de co2 au hémoglobine

Alors concrêtement, un hème oxygéné a une configuration plane et la configuration du nuage électronique qui en résulte, rend les résidus amines de la chaîne peptidique moins nucléophiles. Quand l'hème n'est pas oxygéné ou que le milieu est suffisamment acide pour que les résidus amines fixent des protons, l'hème a une configuration creusée et le nuage électronique résultant perment à (de mémoire) une lysine et je crois une arginine de fixer un hydrogénocarbonate (à vérifier).  [...] La conséquence simple, c'est qu'une hémoglobine oxygénée va relarguer des protons qui vont se combiner aux hydrogénocabonates, redonnant ainsi du dioxyde de carbone par dissociation. À l'inverse, une hémoglobine en milieu acide et/ou qui n'est plus oxygénée va fixer des protons + des hydrogénocarbonates.  [...]

urgent urgent: nomenclature D/L

Il me semble que tu veux parler de la représentation de Fischer,... désolé si je me trompe mais ces cours sont loin derrière moi )))))).   [...] Le L indique que l'on parle de deux acides aminé lévogyres (configuration absolue S), l'un dévie le plan rotatoire de la lumière dans le sens des aiguilles d'une montre (+), lautre dans l'autre sens (-).  [...]

questions sur la biosynthèse de la vitamine C

AH j'allais oublier... une question précédente dans l'exercice consistait en je cite. Donnez la configuration du D-gulose sachant que l'action de l'acide nitrique sur le L-gulose et le D-glucose conduit à un composé unique cette question doit normalement permettre une réaction de la biosynthèse et je suppose que c'est la réaction dont je vous ai parlé plus haut. Répondez moi SVP.  [...] Voila, donc c'est à partir de l'acide glucarique qu'on va déterminer la configuration du D-gulose. Pour se faire, on doit revenir en arrière', càd deviner qu'il est l'aldose qui a subit l'oxydation. Or on partant de l'acide glucarique, on aura deux possibilités, étant donner qu'on ignore.  [...]

[Biochimie] Isomérie optique des acides aminés

Sinon tu détermines la configuration de ton Carbone alpha (celui qui porte les fonctions amine, carboxyle et la chaîne latérale) selon les lois de Cahn Ingold Prelog (R ou S). Tout les acides aminés retrouvés dans la nature, donc les L sont 2S. Donc si tu trouves 2S, il est L, si R c'est D.  [...] Le sens dans lequel une molécule dévie le plan de polarisation de la lumière est déterminé expérimentalement et ne peut se déduire de la configuration à priori.  [...]

[Biochimie] Amylase et amidon

L'amylase est une protéine, une chaine d'acide aminés repliés les uns sur les autres dans une conformation très particulière. En chauffant la protéine on va l'amener à se déplier (pour une question d'entropie, d'énergie tout ça, c'est un peu long à décrire) et hors de sa configuration habituelle, elle n'est plus capable d'exercer sa fonction.  [...] Généralement même si tu refroidis après le milieu, elle ne reprendra plus sa configuration de départ notamment car l'environnement autour de la protéine est différent de celui présent au moment où elle a été pliée pour la première fois.  [...]

Diholosides : liaisons

je ne comprends pas ce qui caractérise la liaison alpha ou bêta entre deux oses. J'ai pourtant bien compris que pour une ose. si le groupement hydroxyle était d'une même côté du plan que le groupement du carbone 6, on avait une configuration bêtà et l'inverse, alpha, mais par exemple dans le cas du lactose.  [...] Il en va de même dans un ose plus long, il y a un certain nombre de liaisons osidiques, dont l'anomérie est fixe, mais une seule position terminale réductrice qui peut avoir les deux en alternance (équilibre) d'ailleur ce sucre en position terminale peut prendre les deux formes de cycles (pyranne/furanne) avoir les deux anomeries, ou etre sous forme linéaire ( 5 formes au total).   [...]

[Biochimie] Anomérie des glucides

Non, si on prend l'énantiomère d'un sucre tous ses C asymétriques auront une configuration inversée (passage du R au S et inversement).  [...] L'anomère de ce sucre cyclisé n'aura qu'un de ses C asymétrique (celui crée par la cyclisation) qui verra sa configuration passer de l'alpha au béta ou inversement (pas de changement de la configuration des autres C asymétriques).  [...]

[Biochimie] Acides aminés

je ne crois pas me tromper en t'expliquant que l'occurrence signifie, ici, la fréquence moyenne à laquelle tel ou tel acide aminé est retrouvé (je ne sais pas dans quel cas et où dans les protéines humaines ) exprimé en %. En gros,à l'aide de ton diagramme, tu dois pouvoir répondre à la question.  [...] Il me semble que l'on regarde si le groupe amine est à gauche ou à droite en représentation de Fischer mais je n'ai que la formule semi-développée des AA et par conséquent je ne peut pas déterminer une configuration.  [...]