• Dossiers - Structure, ADN, Protéines

Activation transmise par une modification de la structure de la chromatine | Dossier

L'hypothèse émise par les auteurs est que les cassures double brin doivent entraîner des modifications dans le noyau capables d'activer l'ATM à distance de la cassure. Des changements dans la chromatine (une structure complexe formée par l' ADN chromosomique et de protéines nucléaires appelées histones ) semblait être une bonne candidate pour expliquer ceci.  [...] L'observation que les levures mutantes pour le RSC ou pour MEC1 ont une sensibilité accrue à l'endommagement de l'ADN permet de penser que tous les eucaryotes pourraient activer la réponses aux cassures double brin par l'intermédiaire de changements de la structure de la chromatine et par des protéines proches de l'ATM.  [...]

La PKC dans la flambée respiratoire chez le granulocyte neutrophile | Dossier

Au cours de cette activation, les protéines Rac et Rap1a jouent un rôle sur la régulation de la NADPH oxydase. La liaison entre Rap1a et la NADPH oxydase est favorisée losqu'un GTP est fixé sur la première des deux protéines (fig. 19). Plus récemment, il est apparu qu'un autre constituant de la NADPH oxydase, la p40-phox, peut être spécifiquement phosphorylée, et donc activée, par la [ protéine kinase C ].  [...] Les radicaux libres de l'oxygène peuvent provoquer plusieurs types de lésions. Une altération des structures lipidiques par la lipoperoxydation essentiellement des acides gras, des acides aminés entraîne des modifications de structure et de propriété des protéines, des acides nucléiques favorisant des perturbations dans la transcription et dans la réplication lorsque les systèmes de réparation sont débordés, modifications également au niveau des sucres impliquant des changements dans les glycoprotéines et des altérations de l' ADN lorsque les désoxyriboses sont touchés.  [...]

Bactéries : les mécanismes de la régulation | Dossier

Ce modèle se décline sous de multiples variantes qu'il n'est pas question de recenser ici. Ce qui est constant c'est que certaines modifications de l'extérieur (composition chimique ou paramètre physique ) sont perçues, car elles modifient la structure d'une ou plusieurs protéines relai, (souvent localisées dans la membrane des bactéries) ce qui entraîne (par des mécanismes divers, mais connus à présent) une modification au niveau de l'ADN qui permet ou empêche respectivement l'expression de gènes utiles ou inutiles à la vie dans les nouvelles conditions.  [...] Et l'étude des interactions entre protéines et ADN et notamment les séquences de nucléotides et les structures protéiques qui permettent la reconnaissance protéine-ADN. Ce faisant, on a découvert que les protéines régulatrices ou sensors appartiennent à des familles trouvées dans de très nombreuses espèces parfois très éloignées, et que les régulations forment des réseaux, avec des systèmes de plus en plus vastes et intégrés au fur et à mesure que les signaux modifient d'avantage de gènes, (donc de fonctions).  [...]

Généralités sur la protéine Kinase C | Dossier

Cette région possède également une zone riche en cystéine qui forme deux structures globulaires appelées structure en doigt de zinc qui sont capables de coordonner 2 ions de zinc (Zn 2+ ), le groupe atypique ne possède qu'une seule structure. Ces cations permettent de maintenir la conformation tridimensionnelle de la protéine.  [...] Par ailleurs, cette structure étant très proche de celle des protéines capables de se lier à l' ADN, il n'est pas impossible que la [protéine kinase C ] puisse également avoir une activité de liaison sur l'ADN (Liu W.S., Heckman C.A., 1997).  [...]

Les virus influenza A : caractéristiques, taxonomie et structure | Dossier

l' hémagglutinine HA et la neuraminidase NA, ancrées dans une bicouche lipidique qui entoure la particule virale. Sous cette enveloppe se trouvent des protéines internes et matricielles, et au centre, une structure moléculaire hélicoïdale associant l'ARN à des complexes de nucléoprotéines et de polymérases.  [...] Les protéines M1 et M2 se trouvent sous la couche lipidique et assurent la cohérence de la structure. La protéine M1 ou protéine matricielle est la plus abondante des protéines virales. Elle s'associe à la partie intracellulaire des protéines de surface et à la nucléoprotéine, et assure la rigidité de l'enveloppe virale.  [...]

Les questions qui demeurent sans réponse | Dossier

1. Comment la modification de structure de la chromatine va t'elle activer l'ATM Est-ce une reconnaissance directe ou indirecte Il existe quelques données permettant de penser que l'activation de l'ATM par les cassures double brin est indirecte. L'ATM est capable de phosphoryler la p53 en dehors des régions endommagées, suggérant qu'un signal a été transmis aux protéines ATM dans ces régions.  [...] 4. Quelle est la spécificité des changements de la chromatine lors de cassures double brin Les modifications de la structure de la chromatine sont fréquentes lors de l'expression des gènes et durant le cycle de division cellulaire lors de la réplication de l'ADN et pourtant l'ATM semble ne pas réagir à de tels changements.  [...]

Qu'est ce que la génomique ? | Dossier

La génomique génère de très nombreuses données en raison du caractère automatisé et exhaustif des techniques modernes. Elle autorise, avec la Physiologie, une vision intégrée des gènes aux phénotypes en passant par les transcripts, les protéines, les métabolites, etc.  [...] ... c'est pourquoi, on parle de biologie intégrative. Cette dernière ne peut se développer sans un stockage raisonné et une analyse globale des données générées aux différents niveaux (transcript, protéines, physiologie). Ces étapes nécessitent le concours de la bio-informatique, autre nouvelle Science en expansion.  [...]

Les catégories de « microbes » | Dossier

Les virus sont des êtres doués d'une grande plasticité, ils mutent facilement et souvent. Au contraire, le passage du virus de la rage du chien sur le lapin entraîne une modification profonde et durable du virus si bien que l'infection de l'homme, à partir du virus ayant séjourné chez le lapin, ne provoque pas la rage.   [...] On parle d'architecture pas de structure virale car le virus n'est pas une cellule. Ils possèdent tous des protéines formant la capside contenant un acide nucléique. Il existe.  [...]

Premières intuitions sur l'évolution du vivant | Dossier

Cette diversité repose sur un matériel de construction commun à (presque) tout ce qui évolue, sur une molécule dont nul n'ignore plus le nom, car on la croise quotidiennement dans les journaux. l' ADN. Cette molécule, au coeur des débats politiques contemporains, des enquêtes policières, des craintes face aux organismes génétiquement modifiés, des promesses thérapeutiques de la médecine, de la création de nouveaux êtres vivants.  [...] Détail de la structure et de la composition des acides nucléiques. L'ARN est un autre support de l'information génétique. Il porte aussi des instructions codant notamment les caractéristiques de certains virus. L'ARN peut aussi fournir une copie des instructions de l'ADN à l'issue du processus de transcription, durant lequel les bases de l'ADN sont copiées en bases d'ARN. Sônk, cc by sa 3.0.  [...]

Conservation des aliments et chaîne du froid | Dossier

Pour certains Escherichia coli pathogènes ou autres Salmonella typhi, par exemple, on estime que quelques bactéries sont suffisantes pour provoquer des symptômes. La température est un facteur clé pour maîtriser le développement ou la destruction de la plupart de ces agents infectieux.  [...] L'augmentation de température est favorable à la bactérie jusqu'à une certaine limite. Si celle-ci est trop élevée, lors d'une cuisson à coeur par exemple, la structure des protéines se modifie. Elles deviennent non fonctionnelles. Mais, contrairement au froid, cette dénaturation est irréversible.  [...]