• Dossiers - Séquence, ARN, Protéines

La traduction du gène en protéine | Dossier

La correspondance entre codons et acides aminés est définie par le code génétique et s'exprime par l'intermédiaire d'une famille d'ARN particuliers, les ARN de transfert ( ARNt ). Chaque ARNt contient la séquence complémentaire d'un codon, l'anticodon, et porte fixé à son extrémité l'acide aminé correspondant.  [...] La synthèse s'achève lorsque le ribosome rencontre un codon stop (des codons UAG, UGA ou UAA) qui indique au ribosome qu'il est arrivé à la fin de la séquence de la protéine. Cette dernière est alors libérée pour aller remplir sa fonction biologique dans la cellule.  [...]

Impact des OGM sur la santé | Dossier

la séquence incluant les gènes qui codent pour la création de l'enveloppe externe protéique des virus, et qui une fois exprimée dans la plante hôte, va donner des protéines qui gêneront les autres virus infectant la plante.  [...] l'aliment GM peut être considéré toxicologiquement et nutritionnellement comme équivalent en substance à l'aliment conventionnel. Par exemple, l'huile issue d'une plante GM est équivalente en substance à l'huile de la même plante naturelle, car dans l'huile il n'y aucune trace d'ADN ni de protéines détectables.  [...]

L'exploration du génome humain et la mesure de la diversité | Dossier

A partir des années 1990, l'exploration du génome humain a été engagée dans le cadre de grands programmes internationaux et a abouti à la lecture intégrale des trois milliards de bases A, T, G ou C que contient l' ADN humain et dont l'ordre, la succession, la séquence renferme les formules des protéines nécessaires à la vie.  [...] Cette faible diversité (inférieure à celle que l'on trouve au sein de chaque espèce de grands singes) est due à l'apparition et l'expansion très récente notre espèce à partir d'une population peu nombreuse (une dizaine de milliers de personnes il y a cinquante mille ans environ).   [...]

Les mécanismes d'expression des gènes | Dossier

D'autres travaux ont mis en évidence que le contexte influençant l'efficacité de terminaison de la traduction était encore plus étendu (6-9 nucléotides) que ce qui avait été préalablement estimé (8, 9). Plusieurs hypothèses ont été avancées pour expliquer le rôle du contexte nucléotidique situé en aval du codon stop (appariement avec l'ARN ribosomique, interaction avec des protéines du ribosome), mais aucune preuve expérimentale n'a encore été apportée pour confirmer ou infirmer ces hypothèses.  [...] Après avoir franchi le codon stop, le ribosome continue la traduction (dans la même phase) jusqu'au codon stop suivant. Cela aboutit à la synthèse d'une protéine possédant une extension carboxy-terminale. Cette extension peut avoir plusieurs conséquences.  [...]

Vaccins antigrippaux : la génétique inverse et les cultures cellulaires | Dossier

Les premiers systèmes de génétique inverse appliqués aux virus influenza A font appel à des virus helper (virus qui assure les fonctions manquantes d'un virus défectif). Un complexe de ribonucléoprotéines (RNP) est produit par la synthèse in vitro des segments d'ARN viral (vRNA) en présence des polymérases et de NP.  [...] un système à deux plasmides basé sur pol II. un plasmide pour la transcription de PA, PB1, PB2. chacune des trois unités de transcription contient l'ARNm codant pour la protéine virale, intercalé entre le promoteur de pol II et une séquence de polyadénylation.  [...]

Analyse chez Arabidopsis thaliana | Dossier

Parmi cette famille deux protéines du système de résistance acquise forment le dimère NPR1/NIM1. Ce dernier a la propriété d' activer la transcription du gène PR1 via la séquence TGCAG (Després et al., 2000). Par conséquent le consensus déterminé pour ces promoteurs d' Arabidopsis thaliana pourrait correspondre à celui reconnu par le facteur de transcription NPR1/NIM1.  [...] La présence sur le promoteur de PR1 de ces deux types de boîtes d'activation, suggère que ce gène intervient dans deux systèmes différents nécessitant des protéines communes à la réponse systémi-que acquise (TGA-bZIP) et à la réponse au stress oxydatif (WRKY).  [...]

Références bibliographiques | Dossier

7. Brown CM, Stockwell PA, Trotman CN, Tate WP. Sequence analysis suggests that tetra-nucleotides signal the termination of protein synthesis in eukaryotes. Nucleic Acids Res 1990, 18.6339-6345.  [...] 14. Howard MT, Shirts BH, Petros LM, Flanigan KM, Gesteland RF, Atkins JF. Sequence specificity of aminoglycoside-induced stop condon readthrough. potential implications for treatment of Duchenne muscular dystrophy. Ann Neurol 2000, 48.164-169.  [...]

Une classe d'antibiotiques particulière : les aminoglycosides | Dossier

Ainsi en présence de ces antibiotiques le ribosome va incorporer plus efficacement le mauvais ARNt. Cette diminution de la fidélité du ribosome va permettre une meilleure incorporation des ARNt au niveau des codons stop, et ainsi augmenter l'efficacité de translecture.   [...] Dans les conditions normales d'expression des gènes le ribosome rencontre le codon stop à la fin de la séquence codante. Seulement ce n'est malheureusement pas toujours le cas et il arrive que la synthèse protéique s'arrête prématurément en raison de l'apparition d'un codon stop.  [...]

Évolution du virus A (H5N1) | Dossier

la substitution de l' asparagine en position 92 par la glutamine, au niveau de la protéine NS1, accroît la résistance du virus à l'activité antivirale des interférons et du facteur nécrose tumorale &alpha. in vitro.  [...] L'arbre phylogénétique des gènes de la protéine M2 évolue de façon parallèle à celui des gènes de la HA. La séquence d'acides aminés de M2 des virus du clade 1 et du clade 1' (A/Hong Kong/213/03) révèle une substitution de la sérine vers l'asparagine au résidu 31.  [...]

Logiciel et méthodologie | Dossier

Le séquençage du génome d'A. thaliana permet de localiser un gène intégralement et par consé-quent le promoteur associé. Cette localisation peut se faire par l'intermédiaire de l'utilitaire Se-quence retrieval du site Internet Regulatory Sequence Analysis tools (Van Helden et al.  [...] L'analyse matricielle par chaîne de Markov est la base de Motif Sampler. Cette analyse mathé-matique calcule les scores entre 2 mononucléotides, de ce fait plus une séquence a d'occurrence plus le score attribué sera élevé. L'association de ce score avec le logarithme de la probabilité d'association détermine la séquence consensus mathématiquement la plus probable (Thijs et al., 2001).  [...]