• Dossiers - Acide aminé, Séquence, Protéine

La traduction du gène en protéine | Dossier

les vingt acides aminés composant les protéines. Il réalise cette opération en lisant la séquence de l'ARN par groupes de trois bases, chaque triplet ou codon indiquant un acide aminé de la séquence de la protéine en cours de fabrication.  [...] Ainsi, les ARNt apportent les acides aminés au ribosome dans l'ordre indiqué par la séquence des codons. Une protéine commence toujours de la même façon, l'acide aminé méthionine codée par le codon initiateur AUG. Suivent les autres acides aminés dans l'ordre indiqué par la séquence des codons sur l'ARN messager.  [...]

Le traitement de la grippe aviaire et des virus influenza | Dossier

Dans le cas du virus influenza A (H5N1), l'analyse des séquences aminoacides de la protéine M2 montre que tous les isolats viraux de génotype Z, circulant en 2003 et en 2004 en Thaïlande et au Vietnam montre une mutation correspondant à l'acide aminé en position 31 (substitution de la sérine par l' asparagine ).  [...] Il suffit d'introduire dans les cellules des petits ARN double brin (ARN interférents) qui ont la même séquence que l'ARN messager du gène à inhiber. on dit qu'ils interfèrent avec l'ARN. L'utilisation d'ARN interférents, spécifiques de régions conservées des gènes de virus influenza A, en particulier, les nucléotides 1496 à 1516 de la nucléoprotéine NP, les nucléotides 2097-2107 de l'ARN transcriptases PA et les nucléotides 2257-2277 de la polymérase PB1 a démontré une activité inhibitrice de la réplication virale in vitro (Bennink and Palmore 2004 12 ).  [...]

Les mécanismes d'expression des gènes | Dossier

Elle commence au codon initiateur (AUG), pour se terminer à l'un des trois codons stop (UAA, UAG ou UGA) (Figure 1). Au niveau de chaque codon, le ribosome incorpore un ARN de transfert ( ARNt ) chargé à son extrémité avec un acide aminé. Cet ARNt possède une séquence complémentaire (anticodon) au codon présent dans le site de décodage du ribosome.  [...] Représentation schématique des sites A et P du ribosome. L'ARNm est repésenté en bleu, les ARNt en noir, les acides aminés par des sphères colorées. L'ARNt pénètre dans le ribosome au site A. Si l'appariement codon/anticodon est correct, alors il y a transfert de la protéine en élongation sur le nouvel acide aminé apporté par l'ARNt.  [...]

Généralités sur la protéine Kinase C | Dossier

La [ protéine kinase C ] est une sérine /thréonine kinase, ce qui signifie qu' elle est capable de phosphoryler d'autres protéines sur les fonctions alcools de ces résidus d' acides aminés, lorsqu'ils sont compris dans une séquence dite consensus. Elle est considérée comme un médiateur classique de nombreux agonistes extracellulaires qui produisent divers seconds messagers lipidiques (Kishimoto A.  [...] Toutefois, des peptides synthétiques ont été utilisés avec la séquence consensus suivante. RXXS/TXRX, où X indique un acide aminé quelconque.  [...]

Les résultats déjà obtenus | Dossier

La plupart des systèmes utilisés pour quantifier l'effet de ces antibiotiques sont des systèmes reporters dans lesquels a été clonée une séquence plus ou moins grande encadrant la mutation non sens. Cette approche bien que très précieuse (et quasi irremplaçable) pour déterminer l'efficacité d'un antibiotique à supprimer un codon stop se heurte à un problème majeur.  [...] Mais ensuite celle-ci doit être active. Or il est tout à fait possible que l' acide aminé incorporé via l'ARNt au niveau du codon stop modifie fortement la structure, l'activité ou la stabilité de la protéine enpêchant ainsi son fonctionnement normal.  [...]

Les cassures double brin et la protéine ATM | Dossier

L'étude de Bakkenist et Kastan montre qu'en absence d'atteinte de l'ADN, les protéines ATM forment des dimères. Cette association les empêche de se lier à d'autres protéines. Lorsqu'une cassure double brin se produit, il y a auto-phosphorylation des protéines formant le dimère au niveau de la sérine 1981.  [...] Comme l'ATM est une protéine de taille importante, identifier l' acide aminé impliqué dans cette activation revenait à trouver une aiguille dans une botte de foin et c'est donc une avancée significative pour la compréhension du mécanisme.  [...]

Prévention chez l'homme par les antiviraux : oseltamivir et péramivir | Dossier

Les études génétiques des isolats aviaires et humains de clade 1 de 2004-2005 en Asie, montrent une substitution d' acide aminé à la position 31 de la protéine M2 du virus A ( H5N1 ). cette mutation confère invariablement une résistance aux adamantanes (WHO Global Influenza Program 2005 65 ).  [...] de même les tests de sensibilité in vitro mettent en évidence une résistance aux adamantanes, du virus A (H5N1) isolé en Thaïlande en 2004 (Chotpitayasunondh, Ungchusak et al. 2005 10 ). Les inhibiteurs de la protéine M2 ne sont pas indiqués à priori en prophylaxie des infections humaines à A (H5N1).  [...]

Espoirs et limites de cette approche thérapeutique | Dossier

Mais à trop forte concentration l'antibiotique risque d'avoir l'effet inverse, en effet nous avons vu que ces antibiotiques provoquaient aussi des erreurs lors de l' élongation (il y a donc incorporation d'un mauvais acide-aminé dans la protéine ). Si ce phénomène (appelé misincorporation) est lui aussi trop important, nous allons provoquer la synthèse de nombreuses protéines anormales, sans pouvoir prédire quels seront leurs effets sur la cellule.  [...] Il est possible que ce problème ait été partiellement résolu récemment par une équipe américaine. Il viens d'être publié au mois de septembre 2002, qu'une nouvelle classe d'antibiotique, les oxazolidinones, qui se lient à une des sous-unités du ribosome, était capable d'induire la suppression des codons stop sans pour autant augmenter le nombre d'erreur du ribosome lors de l'élongation (21).   [...]

La virulence des virus influenza A | Dossier

Cependant, l'intensité de la virulence peut être modulée par la présence d'acides aminés au niveau de régions différentes de l'hémagglutinine des virus A (H5N1). La présence de séquence polybasique au site de clivage n'est pas toujours associée à la virulence, la composition du site de clivage et l'existence d'un résidu acide ayant une influence sur le phénotype pathogène du virus (Hulse, Webster et al. 2004 2 ).  [...] Les protéines du complexe polymérase des virus influenza A sont impliquées dans la virulence du virus A (H5N1). Les études menées sur les souches virulentes et avirulentes isolées chez l'homme au cours de l' épidémie de Hong Kong en 1997, démontrent que le pouvoir pathogène de chacune de ces deux souches est déterminé par l'acide aminé en position 627 de la protéine PB2.  [...]

Discussion en profondeur des mécanismes impliqués | Dossier

Une cellule eucaryote où l'on voit comment les protéines sontfaites. ADN lue par l'ARN polymérase, puis les ribosomes dansle cytoplasme produisent un brin d'acide aminé qui se replie en une protéinefonctionnelle. Nicolle Rager, National Science Foundation. Domaine public.  [...] Les enzymes du métabolisme oxydatif permettant de pourvoir l'organisme en énergie par oxydation du glucose sont codées dans le génome. Par contre la combinaison non enzymatique du glucose avec les fonctions amines libres des protéines et acides nucléiques (la réaction de Maillard) ne l'est pas, ni celle des mécanismes pouvant l'inhiber.  [...]