• Dossiers - Acide aminé, Position, Protéine

Le traitement de la grippe aviaire et des virus influenza | Dossier

Dans le cas du virus influenza A (H5N1), l'analyse des séquences aminoacides de la protéine M2 montre que tous les isolats viraux de génotype Z, circulant en 2003 et en 2004 en Thaïlande et au Vietnam montre une mutation correspondant à l'acide aminé en position 31 (substitution de la sérine par l' asparagine ).  [...] Le zanamivir (Relenza®) est un dérivé de l'acide sialique par addition d'un groupement guanidino de charge positive. il se fixe aux acides aminés chargés négativement du site actif de la neuraminidase virale et agit comme inhibiteur sélectif. Il a été synthétisé en 1989 et commercialisé en 1990.  [...]

La virulence des virus influenza A | Dossier

Les protéines du complexe polymérase des virus influenza A sont impliquées dans la virulence du virus A (H5N1). Les études menées sur les souches virulentes et avirulentes isolées chez l'homme au cours de l' épidémie de Hong Kong en 1997, démontrent que le pouvoir pathogène de chacune de ces deux souches est déterminé par l'acide aminé en position 627 de la protéine PB2.  [...] La souche humaine hautement pathogène A/Vietnam/1203/04 (H5N1) présente la même substitution à la position 627 de PB2 (Govorkova, Rehg et al. 2005 20 ). L'acide aminé en position 627 jouerait un rôle dans l'interaction de la polymérase virale avec des facteurs d'hôtes spécifiques (aviaires ou mammifères ), ou déterminerait la température seuil de l'activité de l' ARN polymérase virale, la réplication virale s'initiant à des températures différentes chez les oiseaux et les mammifères (Noah and Krug 2005 40 ).  [...]

Évolution du virus A (H5N1) | Dossier

la substitution de la glutamine en position 627 par la lysine, au niveau de la protéine PB2 augmente la capacité réplicative du virus.  [...] Ces délétions favoriseraient la rétention des virions au niveau de la membrane plasmique pour contrebalancer la faiblesse de la liaison entre l'HA et l'acide sialique induite par la glycosylation de l'acide aminé en position 154 récemment acquise (WHO Global Influenza Program 2005 98 ).  [...]

Transmission du virus de type A : oiseaux, mammifères et hommes | Dossier

D'une façon générale chez les oiseaux, le virus est excrété au niveau des voies respiratoires, de la conjonctive et des excréments. la transmission se fait par contact direct avec d'autres animaux infectés, ou indirect dans un environnement contaminé par les fientes, les plumes.  [...] On y retrouve la substitution par la lysine de l' acide aminé en position 627, présente dans le génome des virus isolés chez l'homme et absente du virus A (H5N1), responsable actuellement des épizooties (Amonsin, Payungporn et al. 2005 3 ) (Thanawongnuwech, Amonsin et al. 2005 56 ) (Thornley 2004 57 ).  [...]

Variabilité génétique des virus influenza | Dossier

Ces variations antigéniques sont mineures, surviennent environ tous les deux à trois ans et apparaissent essentiellement pour l' hémagglutinine et à moindre titre pour la neuraminidase. Tous les gènes codant pour les autres protéines virales peuvent à priori subir des mutations, dans la limite où les protéines codées par ces gènes conservent des fonctions compatibles avec la réplication virale.  [...] Par ailleurs, neuf isolats A (H1N2) présentent une substitution de l'acide aminé en position 90. il en résulte l'introduction d'un nouveau site de glycosylation adjacent au site antigénique E de HA, et la possibilité d'une modification de l'antigénicité du virus A (H1N2) (Al Faress, Cartet et al. 2005 2 ).  [...]

Les résultats déjà obtenus | Dossier

Mais ensuite celle-ci doit être active. Or il est tout à fait possible que l' acide aminé incorporé via l'ARNt au niveau du codon stop modifie fortement la structure, l'activité ou la stabilité de la protéine enpêchant ainsi son fonctionnement normal.  [...] ..Quoiqu'il en soit ces résultats montrent qu'il est possible de restaurer l'activité d'une protéine par l'utilisation de la gentamicine. Cette restauration n'est pas complète, mais est significative surtout si on prend en compte qu'il peut suffire de quelques % d'activité pour annuler l'effet de la mutation stop.  [...]

Les cassures double brin et la protéine ATM | Dossier

L'étude de Bakkenist et Kastan montre qu'en absence d'atteinte de l'ADN, les protéines ATM forment des dimères. Cette association les empêche de se lier à d'autres protéines. Lorsqu'une cassure double brin se produit, il y a auto-phosphorylation des protéines formant le dimère au niveau de la sérine 1981.  [...] Comme l'ATM est une protéine de taille importante, identifier l' acide aminé impliqué dans cette activation revenait à trouver une aiguille dans une botte de foin et c'est donc une avancée significative pour la compréhension du mécanisme.  [...]

La traduction du gène en protéine | Dossier

Ainsi, lorsque le ribosome rencontre un nouveau codon, l'ARNt vient s'y fixer par son anticodon et fournit au ribosome le prochain acide aminé à incorporer dans la protéine en cours de fabrication.  [...] En amont du travail de lecture du ribosome, les acides aminés sont fixés aux bons ARNt par une famille d' enzymes, les aminoacyl-ARNt synthétases (aaRS). Une fois chargés, les ARNt sont immédiatement véhiculés jusqu'au ribosome par une autre protéine, le facteur d' élongation (EF-Tu).  [...]

Les mécanismes d'expression des gènes | Dossier

L'appariement ARNt-ARNm permet de distinguer l'ARNt qui doit effectivement être incorporé d'un ARNt entré dans le ribosome par erreur (Figure 2). Une fois l'identité de l'ARNt vérifiée, la chaîne protéique en élongation est transférée sur le nouvel acide aminé, grâce à l'activité peptidyl-transferase du ribosome.  [...] Représentation schématique des sites A et P du ribosome. L'ARNm est repésenté en bleu, les ARNt en noir, les acides aminés par des sphères colorées. L'ARNt pénètre dans le ribosome au site A. Si l'appariement codon/anticodon est correct, alors il y a transfert de la protéine en élongation sur le nouvel acide aminé apporté par l'ARNt.  [...]

Espoirs et limites de cette approche thérapeutique | Dossier

Comme nous venons de le voir, la possibilité de soigner certaines maladies génétiques en administrant des aminoglycosides peut être source de grands espoirs, tellement cette solution thérapeutique peut paraître simple. Seulement elle se heurte encore à de nombreux problèmes.  [...] Mais à trop forte concentration l'antibiotique risque d'avoir l'effet inverse, en effet nous avons vu que ces antibiotiques provoquaient aussi des erreurs lors de l' élongation (il y a donc incorporation d'un mauvais acide-aminé dans la protéine ). Si ce phénomène (appelé misincorporation) est lui aussi trop important, nous allons provoquer la synthèse de nombreuses protéines anormales, sans pouvoir prédire quels seront leurs effets sur la cellule.  [...]