• Actualités - Séquence, Génome, Bactérie

Une bactérie bénéfique pour la conservation de la viande

Une équipe de chercheurs de l'INRA a séquencé le génome de la principale bactérie vivant sur la viande et le poisson frais. Lactobacillus sakei. Cette bactérie, utilisée couramment en Europe pour la fermentation des produits carnés comme le saucisson sec, montre des propriétés qui pourraient être utilisées également pour une meilleure conservation de la viande fraîche (ou du poisson), en préservant sa qualité microbiologique.  [...] Une équipe de chercheurs de l'INRA a séquencé et analysé le génome de Lactobacillus sakei afin de répondre à une question principale. quelles sont les fonctions importantes, codées par ce génome qui permettent d'expliquer que cette bactérie soit si bien adaptée à la viande.  [...]

Le rôle des phytochromes pour la première fois déterminé chez des bactéries

Très récemment, une équipe associant l'IRD, le CEA et le CNRS a mis en évidence l'existence de phytochromes chez Bradyrhizobium, une bactérie photosynthétique fixatrice d'azote qui vit en symbiose avec des légumineuses tropicales (les Aeschynomene). En utilisant les outils de la biologie moléculaire, de la biophysique et de la biochimie, ces chercheurs ont pu démontrer le rôle essentiel de ce nouveau phytochrome dans le contrôle de la constitution du photosystème de la bactérie.  [...] En effet, s on génome vient d'être entièrement séquencé et a révélé la présence exceptionnelle, chez une bactérie, de six copies de phytochromes différentes.  [...]

Les secrets génétiques de la bactérie qui nous donne mal aux dents

Le génome de Bifidobacterium dentium a été séquencé. La nouvelle n'est pas anecdotique. cette bactérie est celle qui a appris à vivre sur nos dents et qui y creuse des caries. Son code génétique révèle son étonnante adaptation au milieu buccal et même aux dentifrices.  [...] Mais si elle se prénomme dentium, c'est que la bactérie dont Marco Ventura, de l'Université de Parme, a séquencé le génome, vit sur les dents. Elle y prospère, même, alors que ce milieu n'est pas de tout repos, même sans brossage quotidien. L'équipe a découvert plusieurs gènes qui confèrent à B.  [...]

Une bactérie résistante à tous les antibiotiques découverte à Marseille

Dénaturés, les antibiotiques perdent leur action néfaste pour la bactérie, qui peut continuer à se développer. Mais ce n'est pas tout. On a séquencé son génome il y a maintenant dix ans. Cette bactérie a une capacité à acquérir des gènes de résistance extrêmement facilement et donc il y a une plasticité très importante, et ce n'est pas étonnant qu'elle fasse partie des bactéries susceptibles de devenir résistantes à tout, explique Didier Raoult.  [...] Ce n'est pas la première fois que l'on rencontre une souche d' Acinetobacter baumannii résistante à tous les antibiotiques. Il y a deux ou trois endroits dans le monde où cela a déjà été rapporté, mais c'est très inquiétant. À mon sens, le problème vraiment important est qu'il n'y a pas de nouvelle molécule qui se profile dans l'industrie pharmaceutique, et ce genre d'exemple de bactérie résistante à tout va se multiplier et on ne pourra pas soigner les malades, conclut Didier Raoult.  [...]

La bactérie responsable de la mort de 3 bébés à Chambéry a été nommée

Les chercheurs ont séquencé la totalité du génome de la bactérie et décrit ses caractéristiques phénotypiques. Ils ont ainsi observé qu'elle avait pour particularité de se développer à 4 °C, ce qui est rare chez les entérobactéries qui généralement cessent leur croissance lorsque la température descend en dessous de 8 °C.  [...] Dans un communiqué de presse, l'Institut Pasteur précise que les souches bactériennes isolées, ainsi que toutes les données génomiques collectées ont été mises à disposition de la communauté scientifique, en libre accès.  [...]

L'amibe : un lieu de rencontre pour les bactéries intracellulaires

Avec l'aide du Génoscope, les équipes de Didier Raoult et de Jean-Michel Claverie ont déterminé et analysé la séquence complète du génome de la bactérie intracellulaire Rickettsia bellii. Ils y ont découvert de nombreux indices de transfert de gène entre cette bactérie et d'autres bactéries intracellulaires, Legionella pneumophila (l'agent de la dangereuse pneumonie des légionnaires) et Protochlamydia amoebophila (proche de Chlamydia trachomatis ).  [...] Genome sequence of Rickettsia bellii Illuminates the Role of Amoeba in Gene Exchanges Between Intracellular Pathogens. Hiroyuki Ogata, Bernard La Scola, Stéphane Audic, Patricia Renesto, Guillaume Blanc, Catherine Robert, Pierre-Edouard Fournier, Jean-Michel Claverie, Didier Raoult. (2006). PLoS Genet.  [...]

Allergies et asthme : la faute à notre flore bactérienne ?

Un scientifique suédois de l'Institut Karolinska, Bengt Björkstén, étudie ces questions depuis plus de dix ans. Dans son pays, la fréquence de l'asthme et de l'eczéma a doublé en vingt ans. Ce chercheur veut ajouter un facteur possible de plus. la flore bactérienne de l'intestin.  [...] Après avoir séquencé le génome humain, les scientifiques veulent aujourd'hui s'attaquer à ceux de nos bactéries. L'ensemble de leurs gènes est appelé microbiome et peut s'étudier globalement (et non pas bactérie par bactérie) grâce aux méthodes de la métagénomique, très en vogue.  [...]

Le génome d'une bactérie "insecticide" décrypté

Le génome de Photorhabdus luminescens, une bactérie pathogène d'insectes vivant en symbiose avec un ver (nématode), vient d'être entièrement séquencé par une équipe de l'Institut Pasteur (associée au CNRS). Son analyse, publiée dans Nature Biotechnology (E.  [...] Rien d'étonnant donc à ce que les chercheurs aient identifié des gènes de toxines susceptibles de tuer de nombreux insectes. Mais il faut préciser qu'aucun génome bactérien aujourd'hui séquencé n'avait permis de trouver autant de gènes de toxines entomopathogènes.  [...]

Une bactérie créée de main d'Homme... et minimaliste

En 1995, l'équipe de Venter a séquencé le génome de Mycoplasma genitalium, une bactérie sexuellement transmissible qui possède le plus petit génome connu pour un organisme capable de vivre seul. 580 kilobases (kb), avec 470 gènes codant pour des protéines.  [...] En 2010, l'équipe a copié le génome bactérien de M. mycoides et l'a greffé dans une autre bactérie ( M. capricolum ). Les cellules obtenues, JCVI-syn1.0, étaient le premier exemple de vie synthétique. Ce génome de 1.079 kb basé sur celui de M. mycoides (JCV-syn1.  [...]

Le premier génome bactérien créé par ordinateur

Des chercheurs de l'école polytechnique de Zurich ont réécrit informatiquement le génome d'une bactérie afin qu'il soit plus simple à produire chimiquement en laboratoire. Cette innovation pourrait révolutionner les biotechnologies.  [...] Un nouveau génome vient de faire son entrée dans la banque de données des génomes connus. celui de la bactérie Caulobacter ethensis-2.0, le premier génome entièrement créé par ordinateur. Mais si ce génome est bien réel, l'être vivant correspondant n'existe pas encore.  [...]