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Maladies nosocomiales : séquencer le génome bactérien pour les contrer

Une équipe de chercheurs dirigée par Evan Snitkin du National Human Genome Institute de Bethesda (Maryland) a tenté une approche innovante. le séquençage du génome entier de la bactérie. Laquelle a été prélevée sur chacun des patients.  [...] Selon eux, à l'avenir, le séquençage de génome en temps réel de ce type de bactérie pourrait devenir un outil de choix pour améliorer le contrôle des épidémies nosocomiales.  [...]

Le gène de l'odeur de la terre

Cette bactérie produit également certains agents anti-cancéreux ainsi que des immunosuppresseurs. Elle est donc l'objet d'intenses recherches.  [...] Un an après avoir fini le séquençage de son génome avec l'aide du Wellcome Trust Sanger Centre de Cambridge, et pour faciliter son étude, les scientifiques du JIC ont développé un mécanisme d'inactivation des gènes chez cette bactérie en utilisant la bibliothèque de cosmides utilisée pour le séquençage.  [...]

Une bactérie bénéfique pour la conservation de la viande

Une équipe de chercheurs de l'INRA a séquencé le génome de la principale bactérie vivant sur la viande et le poisson frais. Lactobacillus sakei. Cette bactérie, utilisée couramment en Europe pour la fermentation des produits carnés comme le saucisson sec, montre des propriétés qui pourraient être utilisées également pour une meilleure conservation de la viande fraîche (ou du poisson), en préservant sa qualité microbiologique.  [...] C'est la conjugaison de ces trois caractéristiques, dont certaines n'étaient pas suspectées avant le séquençage de ce génome, qui fait que cette bactérie présente donc bien des atouts pour être utilisée comme agent biopréservant de la viande.  [...]

Le génome de l'oursin de mer décrypté

Il aura fallu 3 ans pour séquencer les 814 millions de paires de bases de l'organisme au sein d'un projet co-dirigé par le Dr. George Weinstock du Centre de Séquençage du Génome Humain au Baylor College of Medecin au Texas, en collaboration avec le Mount Desert Island Biological Laboratory à Bar Harbor (MDIBL, Main).  [...] Ainsi, après le séquençage du génome humain et de nombreux organismes vivants, le séquençage du génome de l'oursin de mer apporte des informations cruciales qui permettent, en terme d'évolution, de remplir un intervalle restée jusque là vide.  [...]

Le génome du co-découvreur de l'ADN décrypté !

En 2003, le projet dit du génome humain était venu à bout du séquençage complet des gènes d'un être humain mais il s'agissait d'une liste établie à partir de nombreuses personnes. On a donc beaucoup appris sur le nombre et la nature des gènes de l' espèce humaine mais pas sur les disparités génétiques entre chacun de nous.  [...] Les progrès semblent en effet considérables si l'on compare les deux mois nécessaires au décryptage du génome du docteur Watson aux treize années de labeur qui ont conduit en 2003 au premier séquençage du génome humain. La technique utilisée est nouvelle et l'ADN, extrait du sang, a été multiplié par PCR ( Polymerase Chain Reaction ), sans imposer le recours au clonage dans des bactéries.  [...]

Des bactéries vivent avec un génome fabriqué de main d'homme !

L'homme est célèbre, lui aussi. John Craig Venter s'est fait connaître en 2000 comme co-auteur du premier séquençage du génome humain. Fondateur d'un institut privé qui porte son nom, il avait lancé ses équipes sur la piste du génome synthétique, annonçant en 2003 la synthèse de l'ADN d'un virus, en l'occurrence le bactériophage Phi-X174.  [...] Cette année-là, l'équipe parvient à reconstruire l'intégralité de l'ADN de cette bactérie. L'opération est ardue. Le génome de 582.970 paires de bases est construit en plusieurs étapes, conduisant à une multitude de fragments. Il faut alors l'assistance d'une autre bactérie, plus grande et bien connue ( Escherichia coli ), dans laquelle ils ont été injectés, pour les associer en un unique chromosome.  [...]

Un mammouth cloné naîtra-t-il avant 2018 ?

Un biologiste du Mammoth Genome Project en plein séquençage d'ADN de mammouth. S.C. Schuster & Colleagues/Mammoth Genome Project.  [...] Quant au mammouth laineux, le meilleur score actuel est un séquençage de 75 % du génome, réalisé par deux généticiens du Mammoth Genome Project.  [...]

Les bactéries, producteurs énergétiques et remède contre la pollution ?

Les neuf millions de dollars sur trois ans ainsi accordés serviront à l'identification de bactéries évoluant dans la mer des Sargasses, au large des Etats-Unis, et au séquençage de leur génome.  [...] L'étude du code génétique de bactéries consommant du dioxyde de carbone et rejetant de l' hydrogène a déjà commencé. Ce faisant, Venter et ses collègues espèrent exploiter ce type de capacités et les utiliser, par exemple, pour produire de l'hydrogène comme carburant ou dégrader le dioxyde de carbone émis par l'industrie.  [...]

Le séquençage du génome, bientôt destiné à tous ?

Afin d'évaluer le risque de maladies diverses, certains individus en bonne santé se mettent en tête de faire procéder au séquençage de leur génome. Les chercheurs prédisent une baisse suffisante des prix pour rendre cette procédure très accessible.  [...] Au centre médical Mount Sinai de New York, le projet HealthSeq a réalisé le séquençage du génome de 35 participants en bonne santé et a suivi ces derniers dans le temps afin de comprendre l'expérience de leur point de vue. L'étude a été publiée dans la revue European Journal of Human Genetics.  [...]

Haïti : l'épidémie de choléra proviendrait bien d'Asie

L'épidémie de choléra qui sévit en Haïti serait bien originaire d'Asie, d'après les données issues du séquençage du génome de la souche bactérienne impliquée. Ces résultats redonnent du crédit aux rumeurs qui supposaient l'import du vibrion cholérique par des soldats népalais.  [...] Le choléra, toxi-infection intestinale due au vibrion cholérique, se transmet par la consommation d'eau ou d'aliments contaminés. Et plus rarement, par contact direct avec un malade. La maladie se manifeste par des diarrhées intenses. En l'absence de prise en charge adéquate, celles-ci peuvent provoquer la déshydratation du patient.   [...]