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Un bio-informaticien linguiste ?

Depuis que le projet Génome humain a débuté le décryptage des milliers de bases qui composent notre ADN, les biologistes ont pu décoder des milliers de gènes qui sont à la base de la fabrication des protéines dans notre corps. En fait, les gènes composant notre ADN semblent représenter seulement 3% de toutes les bases composant notre ADN.  [...] Ce bioinformaticien a eu l'idée de créer un programme afin de cataloguer tous les mots de la langue anglaise que l'on pouvait trouver dans Swiss-Prot (Swiss-Prot étant une base de données de protéines utilisée comme outil de référence). En utilisant un petit programme et en combinant la Swiss-Prot, et un dictionnaire informatisé de langue anglaise (complete english ispell library), il a pu y déceler que le mot de plus de 5 lettres qui y revenait le plus souvent est ALLELE ( ALLÈLE, type de gènes ) et que le mot le plus long est CHAPSTICK (produit en bâton que l'on met sur les lèvres gercées).   [...]

Décryptage du génome de la souris de laboratoire

Le décryptage quasiment complet du génome de Mus musculus, la souris commune, et la possibilité de comparer son génome à celui de l'être humain risquent de bouleverser bien des idées reçues, en particulier le concept selon lequel de grands morceaux d'ADN du génome ne seraient que des vestiges sans utilité résultant de l'évolution.  [...] Qui plus est, ces aires seraient aussi étendues que les régions contenant les gènes eux-mêmes. Ces travaux sont le fruit de la collaboration d'une équipe internationale composée de chercheurs du Whitehead Institute for Biomedical Research de Cambridge (Massachusetts), de la Washington University de Saint Louis (Missouri), de l'European Bioinformatics Institute et du Wellcome Trust Sanger Institute, tous deux de Cambridge (Angleterre).   [...]

Le génome du co-découvreur de l'ADN décrypté !

Mais la technique est encore loin d'être au point. Le travail de deux mois qui a conduit au décryptage de l'ADN de Watson, mené au Human Genome Sequencing Center (HGSC) et avec l'aide de la société 454 Life Sciences, a coûté la bagatelle d'un million de dollars.  [...] Les progrès semblent en effet considérables si l'on compare les deux mois nécessaires au décryptage du génome du docteur Watson aux treize années de labeur qui ont conduit en 2003 au premier séquençage du génome humain. La technique utilisée est nouvelle et l'ADN, extrait du sang, a été multiplié par PCR ( Polymerase Chain Reaction ), sans imposer le recours au clonage dans des bactéries.  [...]

Génome humain : du nouveau sur le chromosome X

Deux publications parues dans le numéro de Nature datant du 17 mars apportent de nouvelles données riches en enseignements sur le chromosome X humain. La première d'entre elles annonce l'analyse complète de ce chromosome, et la seconde se penche sur la question de l'inactivation de l'un de ses exemplaires chez la femme.  [...] Les résultats obtenus par cette étude internationale devraient fournir des outils permettant de mieux comprendre l'évolution de cette partie du génome humain, ainsi que les relations qui la lient au chromosome Y.  [...]

Lutte contre l'obésité: la réponse sera-t-elle technologique ?

Ceci devrait aider notablement les personnes soucieuses de maintenir ou de retrouver leur ligne. Ces résultats sont obtenus par la production d'une vapeur super-réchauffée ayant une température supérieure à 300°C, cette température est suffisamment élevée pour liquéfier les graisses qui sont entraînées en dehors des aliments.   [...] Lire la suite. Décryptage du génome humain. le chromosome 5 se dévoile.  [...]

Décryptage du génome de l'ascidie solitaire

Après le décryptage du génome humain, du moustique, de la souris commune, du nématode, de la drosophile et du poisson globe, c'est au tour de l'ascidie solitaire (Ciona intestinalis).  [...] En tout, le génome de l'ascidie solitaire renferme 15 000 à 16 000 gènes, soit environ la moitié de celui d'un être humain. L'étude de ce tunicier devrait contribuer rapidement à la compréhension de l'interaction et de la régulation des gènes.  [...]

Cartographie du génome : de nouvelles perspectives avec ''hapmap''

Le peu de retombées suite au décryptage du génome humain réalisé dans le cadre du Human Genome Project pour lequel trois milliards de dollars ont été dépensés a entraîné une certaine déception.  [...] L' ADN du génome humain est transmis par blocs entiers, appelés haplotypes, à chaque génération. Selon ces chercheurs, il serait donc envisageable d' identifier quelques marqueurs de ces haplotypes afin de réaliser des comparaisons bien plus significatives du matériel génétique.  [...]

La génomique contre les infections nosocomiales : la guerre est déclarée

Cet épisode dramatique, doublé d'une convergence d'intérêts scientifiques, allait inciter un consortium d'équipes françaises du CNRS, de l'Université de la Méditerranée, du génoscope et de l'hôpital de Bicêtre (1), à se lancer dans le décryptage du génome de la bactérie Acinetobacter baumannii, l'un des derniers pathogènes humain majeurs encore non caractérisé au plan génomique.  [...] La comparaison du génome (d'environ 4 millions de nucléotides ) d'une souche multi-résistante à celui d'une souche restée sensible (associée au pou humain) a révélé la plus grande concentration de gènes de résistance (appelé îlot de résistance ) jamais découverte.  [...]

En image : les secrets de l'ADN

Le projet ambitieux du séquençage du génome humain s'est achevé il y a dix ans. Pour fêter cet événement, Futura-Sciences vous invite à découvrir l'ADN sous toutes ses formes grâce à une étonnante galerie photo.  [...] Finalement, les 23 paires de chromosomes, les 20.000 gènes et les 4 milliards de paires de bases contenus dans chacune de nos cellules n'ont fini de livrer leurs secrets qu'en 2004. Enfin, si la succession des nucléotides est désormais connue, le décryptage de l'ensemble des informations portées par le génome humain est un travail de très longue haleine qui ne finira probablement jamais.  [...]

Un champignon forestier intéressant

L'inventaire des 20 000 gènes du Laccaire permettra, grâce à des travaux complémentaires en physiologie, en génétique et en écologie, une avancée spectaculaire des connaissances sur la biologie des champignons et des arbres associés. Le décryptage de ce génome va permettre d'accélérer les programmes de recherche déjà en cours à l'INRA sur la formation et le fonctionnement des symbioses racinaires, le développement des fructifications comestibles, l'écologie des populations des champignons forestiers et le fonctionnement des cycles biogéochimiques.  [...] Le Centre de Très Grand Séquençage du Département de l'Energie américain a mis à la disposition de ce consortium près d'un million de séquences d' ADN permettant, une fois assemblées et annotées, le décryptage de ce génome.  [...]