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Séquençage de l'ADN : bien plus vite et bien moins cher

Deux études proposent des méthodes globalement assez similaires pour réaliser un séquençage de l'ADN abordable et bien plus rapide. Le principe. faire passer un simple brin de la molécule dans un trou minuscule et détecter la signature électronique au passage de chacun des nucléotides.  [...] Le Projet génome humain a été lancé en 1990 pour déterminer le séquençage complet de l'ADN humain. Il s'est terminé avec succès en 2003, mais a coûté des centaines de millions de dollars et a pris treize ans. Les chercheurs annoncent que grâce à leurs techniques basées sur un nanopore, ils pourraient très nettement réduire les tarifs et les durées.  [...]

L'ADN du mammouth laineux séquencé aux trois quarts

Après rinçage des poils à l'eau de Javel (pour détruire les traces d'ADN étrangers en surface), l'échantillon a été soumis à une méthode récente et très efficace de séquençage automatique, connue sous le nom de 454, mise au point par la société Roche. Grâce à elle, 3,3 milliards de paires de bases ont été déchiffrées.  [...] Ces résultats confortent aussi l'intérêt du pelage comme source potentielle d'ADN et soulignent la rapidité des progrès en matière de séquençage. Alors qu'une armada de biologistes et des moyens lourds ont été nécessaires pour séquencer le génome humain et ses trois milliards de paires de bases entre le début des années 1990 et 2001, le même travail sur le génome du mammouth a été réalisé en très peu de temps par une équipe modeste et un petit budget.  [...]

Maladies nosocomiales : séquencer le génome bactérien pour les contrer

Le séquençage de l'ADN bactérien nécessite moins de temps que pour l'ADN d'un eucaryote car il est beaucoup plus court. Il se compose par exemple de 6 millions de paires de bases pour Klebsiella pneumoniae tandis qu'il est de 3,2 milliards pour l'être humain.  [...] Une équipe de chercheurs dirigée par Evan Snitkin du National Human Genome Institute de Bethesda (Maryland) a tenté une approche innovante. le séquençage du génome entier de la bactérie. Laquelle a été prélevée sur chacun des patients.  [...]

Un virus totalement créé par l'homme

Le scientifique à l'origine de cette découverte n'est pas inconnu du grand public, puisqu'il s'agit de Craig Venter qui avait fait parler de lui à l'époque du séquençage du génome humain en tentant de finir le séquençage du génome avant le consortium international.  [...] La nouvelle technique appelée PCA (Assemblage par Polymérisation en Chaîne) permet dans la même étape de réaction de recopier les fragments d'ADN du génome et de les lier entre eux (les détails seront connus lors de la publication de ces travaux dans les Comptes rendus de l'Académie des Sciences américaines dans quelques semaines).  [...]

Avons-nous dans nos cellules des gènes de Néandertaliens ?

Pour tenter de lever le voile sur cette énigme, grâce au progrès en matière de séquençage d' ADN, des chercheurs ont entrepris de comparer le génome des deux types d' hominidés. En 2006, un article publié dans Science par un groupe de biologistes du Lawrence Berkeley National Laboratory ( Berkeley Lab ) et du Joint Genome Institute (JGI) annonçait, en se basant sur l'étude de 65.  [...] 000 paires de base de l'ADN nucléaire de Homo neanderthalensis, que ce dernier possédait au moins 99,5 % du génome de Homo sapiens sapiens. Toutefois, aucun indice d'un croisement n'avait émergé du séquençage de cet ADN.  [...]

Le génome du co-découvreur de l'ADN décrypté !

Mais la technique est encore loin d'être au point. Le travail de deux mois qui a conduit au décryptage de l'ADN de Watson, mené au Human Genome Sequencing Center (HGSC) et avec l'aide de la société 454 Life Sciences, a coûté la bagatelle d'un million de dollars.  [...] Reste que l'entreprise n'est pas sans risque pour les deux volontaires. En rendant disponible pour la communauté scientifique la liste de leurs gènes, ils exposent leurs propres faiblesses génétiques mais aussi celles de leurs proches. Mais la compréhension du génome humain reste encore bien imparfaite.  [...]

La médaille d'or du CNRS pour Jean Weissenbach, un des pères du Généthon

En établissant une carte du génome humain dans les années 1990, Jean Weissenbach a fourni un instrument remarquable aux généticiens du monde entier. Cofondateur du Généthon, aujourd'hui directeur du Génoscope, il vient de recevoir la plus haute distinction scientifique française.  [...] En 1997, le chantier devient celui du séquençage complet du génome humain. Jean Weissenbach prend la direction du Génoscope, ou Centre national de séquençage, nouvellement créé et dépendant du CEA. Une sorte de compétition s'est alors engagée avec des instituts de recherche privés.  [...]

L'Hominidé de Denisova : un nouveau cousin vieux de 30.000 ans

Le séquençage d'une partie importante du génome d'un Hominidé de sexe féminin trouvé dans la grotte de Denisova, dans les montagnes de l'Altaï, au sud de la Sibérie, confirme ce que son ADN mitochondrial avait déjà révélé. Il y a 30.000 ans vivait dans cette région des humains n'appartenant ni à la famille des Hommes de Néandertal ni à celle des Hommes de Cro-Magnon.  [...] La même équipe, complétée par d'autres chercheurs et toujours menée par Svante Pääbo, vient de publier un article dans Nature portant sur le séquençage du génome porté par l'ADN extrait d'un fragment de doigt d'une petite fille âgée de cinq à 10 ans lors de sa mort.  [...]

Un mammouth cloné naîtra-t-il avant 2018 ?

Un biologiste du Mammoth Genome Project en plein séquençage d'ADN de mammouth. S.C. Schuster & Colleagues/Mammoth Genome Project.  [...] Quant au mammouth laineux, le meilleur score actuel est un séquençage de 75 % du génome, réalisé par deux généticiens du Mammoth Genome Project.  [...]

Les microbes aériens, nouvelle marotte de Craig Venter

Craig Venter, qui s'est fait connaître à travers le programme de séquençage du génome humain de sa société Celera Genomics, a décidé de passer en revue les populations microbiennes du ciel new-yorkais.  [...] La phase pilote de son Air Genome Project, dirigé par le Craig Venter Institute et financé à hauteur de 2,5 millions de dollars par l'Alfred Sloan Foundation, consiste en une station de prélèvement portative placée sur le toit d'un immeuble de Manhattan dont l'emplacement a été tenu secret.  [...]