• Actualités - Chercheurs, Séquences, échantillons

Patient zéro : le Sida n'est pas arrivé aux États-Unis par Gaëtan Dugas

Les chercheurs ont récupéré plus de 2.000 échantillons de sang provenant d'hommes testés en 1978 et 1979 pour l' hépatite B. Ils ont ainsi pu séquencer le VIH dans huit échantillons. trois provenant de San Francisco et cinq de la ville de New York. Ces huit séquences font partie des neuf séquences les plus anciennes de VIH-1 du groupe M à ce jour.  [...] L'analyse des séquences montre que les souches étaient similaires à celles présentes aux Caraïbes, en particulier à Haïti, au début des années 1970. De plus, elles étaient assez différentes les unes des autres, suggérant que le virus circulait déjà et avait muté.  [...]

Mammifères : à chacun son pneumocyste

Une équipe de chercheurs de l' IRD en collaboration avec d'autres instituts a évalué à partir de données moléculaires, la parenté évolutive de différentes espèces de pneumocystes prélevées chez des Primates. La comparaison des phylogénies respectives de ces pneumocystes et de leurs hôtes suggère qu'ils ont évolué conjointement au cours des temps géologiques.  [...] Pour reconstituer la parenté évolutive des pneumocystes et ainsi vérifier cette hypothèse, les chercheurs de l'IRD en collaboration avec d'autres instituts ont comparé les séquences de trois gènes, à partir d'échantillons prélevés dans les voies respiratoires ou le tissu pulmonaire d'une vingtaine d'espèces de Primates.  [...]

Cancers : certains ARN seraient de bons biomarqueurs

En analysant les longs ARN non codants du transcriptome, des chercheurs de l'université du Michigan ont trouvé que certains d'entre eux étaient spécifiques du cancer. Voilà qui pourrait permettre de développer de nouveaux biomarqueurs afin d'améliorer le diagnostic et le traitement du cancer.  [...] Les chercheurs ont rassemblé 25 études indépendantes totalisant 7.256 échantillons de séquences ARN de tumeurs, de tissus normaux et de lignées cellulaires, provenant de sources publiques (le projet Cancer Genome Atlas et les archives du Michigan Center for Translational Pathology, dont Arul Chinnaiyan, l'auteur de l'étude, est aussi le directeur).  [...]

SRAS : le retour de la pneumonie atypique au Canada ?

Néanmoins chez trois des victimes ainsi que chez certains malades les échantillons se sont révélés positifs pour la présence du virus du SRAS. Actuellement 9 résidents d'une autre maison de retraite présentent les mêmes symptômes. Ces deux maisons de retraite partagent du personnel médical avec un hôpital qui traita deux cas probables de SRAS au début de l'année.  [...] Jusqu'à présent les efforts pour cultiver ce mystérieux virus ont été vains mais les chercheurs ont annoncé que 800 nucléotides provenant de 4 régions du virus ont été séquencés à partir de virus isolés dans 8 échantillons. Pour 7 des échantillons les séquences se sont révélées totalement identiques à celles du virus du SRAS, pour le huitième échantillon une seule différence a été observée.  [...]

SIDA : le réservoir naturel du VIH identifié 25 ans après !

La question de l'origine du VIH-1, responsable de la pandémie du SIDA, agite la communauté scientifique depuis de nombreuses années. Vingt-cinq ans après la découverte du virus du SIDA, une étude menée au Cameroun par des chercheurs d'une unité associant l'IRD et l'université de Montpellier 1, de l'université d'Alabama, de l'université de Nottingham et du Projet PRESICA (prévention du Sida au Cameroun), publiée le 25 mai 2006 dans Science, lève le voile.  [...] Ils ont pour cela analysé 599 échantillons de fèces de différentes communautés de chimpanzés collectés dans les régions les plus reculées de la forêt tropicale camerounaise. A partir de ces échantillons, les chercheurs ont isolé en laboratoire les anticorps anti SIVcpz et séquencé l' ARN viral présent dans les fèces.  [...]

Le lait maternel contiendrait plus de 700 espèces de bactéries

Dix-huit nouvelles mamans ont accepté de participer à cette étude et de donner des échantillons de leur lait à la naissance, un mois après et enfin six mois après l' accouchement. Grâce à une technique d'amplification d' ADN et de séquençage, les chercheurs ont pu déterminer la composition du microbiote dans le lait maternel en fonction du temps.  [...] En revanche, après 1 et 6 mois apparaissent d'autres microbes des genres Veillonella, Leptotrichia et Prevotella. Ces microorganismes s'épanouissent typiquement dans nos cavités buccales. Les scientifiques sont pour l'heure dans une impasse. ces bactéries viennent-elles du lait pour coloniser la bouche des bébés, ou au contraire passent-elles du nourrisson à la mère pendant la tétée.   [...]

Cancer de la glande surrénale : la génomique apporte des précisions

Pour ce travail, les chercheurs ont récolté 130 échantillons de corticosurrénalomes. Les génomes de ces tumeurs ont été analysés en détail grâce à la combinaison de plusieurs techniques de génomique à haut débit. séquençage, analyse du niveau d' expression des gènes et des micro-ARN, étude des variants génétiques et examen du niveau de méthylation des gènes.  [...] Les glandes surrénales sont situées au-dessus des reins. Elles jouent le rôle de sécrétrices d'hormones. Les tumeurs du cancer de la corticosurrénale ont été étudiées par une équipe de chercheurs. NIH, Wikimedia Commons, DP.  [...]

La peau, une vraie ménagerie de champignons

Au vu de cette recrudescence, il devient impératif de mieux étudier et comprendre le microbiote fongique de la peau. Des chercheurs du National Human Genome Research Institute ( NHGRI ) se sont attelés à cette tâche. Grâce à des techniques de séquençage, ils ont identifié une grande diversité de populations de champignons présentes sur la peau.  [...] Les chercheurs ont collecté des échantillons provenant de dix personnes saines. Les prélèvements ont été réalisés sur 14 zones du corps fréquemment infectées par des champignons, telles que les pieds, les mains et les plis des bras. Par des techniques de séquençage, ils ont mis en évidence la présence de plus de 80 genres de champignons différents appartenant à deux embranchements, les basidiomycètes et les ascomycètes.  [...]

De grandes craintes autour de la grippe du poulet Hollandaise

L'épidémie de grippe du poulet qui frappe actuellement la Hollande a déjà causé environ une trentaine d'infections des yeux chez les fermiers. Les infections en elles-mêmes ne sont pas dangereuses, en revanche, avec l'arrivée de la saison de grippe humaine il est possible que les deux virus se rencontrent.   [...] En 1997, des chercheurs annoncèrent la découverte de rares spécimens du virus de la grippe Espagnole préservés dans d'anciens échantillons de tissus. Grâce à ces échantillons, les chercheurs espèrent pouvoir identifier les mutations qui ont été à l'origine de la très forte pathogénicité de cette souche virale.  [...]

Tramadol : molécule antidouleur, retrouvée à haute dose dans une plante

Pour confirmer leurs résultats parus dans Angewandte Chemie, les chercheurs ont testé différents procédés pour prouver l'authenticité de cette origine naturelle. Leurs analyses ont par ailleurs été confirmées par trois laboratoires indépendants ayant reçu différents échantillons à diverses périodes de l'année.  [...] Enfin, pour exclure la possibilité d'une contamination non intentionnelle des échantillons par du tramadol de synthèse, les chercheurs ont prélevé des échantillons à l'intérieur même des racines et ont pu confirmer la présence de la molécule. D'un point de vue quantitatif, la concentration de tramadol dans les extraits d'écorce séchée est de 0,4 % et de 3,9 %, soit des niveaux très élevés de principe actif.  [...]