• Actualités - Chercheurs, Recherche, SNP

Les niveaux d'expression génique sont importants dans le phénotype

En général, les chercheurs étudient un seul caractère et cela nécessite plusieurs années de recherche intensive avant qu'une explication génétique ne voie le jour. Les membres de l'équipe de Vivian Cheung de l'Université de Philadelphie ont abordé le sujet de manière plus rapide en analysant simultanément des milliers de caractères puis ont utilisé les informations glanées pour revenir sur des bases génétiques.  [...] Grâce au programme HapMap développé par le National Human Genome Research Institute des NIH, les chercheurs ont recherché des SNP (Single Nucleotide Polymorphisms) situés à proximité des gènes identifiés. Les SNP sont des variations ponctuelles d'une paire de base de l' ADN.  [...]

La longévité des centenaires, une affaire de gènes

Les chercheurs ont aussi constaté que 90% des centenaires inclus dans l'étude pouvaient être classés en 19 catégories, en fonction des combinaisons de SNP qu'ils possédaient.  [...] Les chercheurs de l'étude veulent cependant rester prudents pour plusieurs raisons. Tout d'abord, ces données analysées à partir d'un nombre limité de personnes ne peuvent pas être considérées comme exactes avant qu'elles aient été vérifiées sur un plus grand échantillon.  [...]

Ce gène qui peut vous faire paraître plus vieux que votre âge

Les scientifiques ont recherché des associations entre l' âge apparent des participants et des millions de variations dans leur génome. les SNP ( single nucleotide polymorphisms ). Les associations génétiques les plus fortes concernaient des SNP du gène MC1R.  [...] Les chercheurs ont remarqué que l'effet de MC1R pouvait se rapprocher de celui du tabagisme, qui a aussi pour effet de faire paraître plus vieux.  [...]

Parfois, les mauvais gènes nous protègent

Certains SNP favorisent la maladie alors que d'autres protègent contre son apparition. Les chercheurs du Stanford University School of Medicine ont voulu analyser l'évolution des SNP de sept maladies. le diabète de type 1 et de type 2, l' arthrite rhumatoïde, l' hypertension, la maladie de Crohn, la maladie des artères coronaires et le trouble bipolaire.  [...] Grâce à une technique récente basée sur l'étude des haplotypes (groupe de gènes côte-à-côte sur un chromosome ), il est possible de déterminer la tendance évolutive récente d'un gène. Dans la revue Plos One, les chercheurs ont montré que 80 SNP liés au diabète de type 1 étaient de plus en plus répandus, montrant qu'ils étaient sélectionnés positivement.  [...]

Il y a finalement tant de différences génétiques entre nous...

L'un des membres de l'équipe, Stephen Scherer ( Hospital for Sick Children, Toronto, Canada), a mené de son côté une autre étude sur les deux séquences du génome humain actuellement connues, celle du consortium international et celle de Celera Genomics. Elle a repéré 220 régions variables et a également recherché des zones appelées SNP ( single-nucleotide polymorphisms ) portant de minuscules différences, n'affectant qu'une seule paire de bases. L'équipe a détecté 1,5 million de SNP.  [...] On impute déjà à ces régions variables d'être impliqués dans des prédispositions à plusieurs maladies, comme celle d' Alzheimer ou le Sida. Le projet international HapMap cherche actuellement à traquer les SNP. Il faudra aussi penser aux CNV.  [...]

Intelligence humaine : 40 gènes identifiés

Dans un article paru dans Nature Genetics, une équipe internationale a recherché des marqueurs liés à l'intelligence dans 13 groupes de personnes descendant de populations européennes. En tout, 78.308 individus ont participé. Sur 52 gènes ainsi identifiés, 40 étaient nouveaux et s'exprimaient surtout dans le cerveau.  [...] Les chercheurs ont ensuite examiné près d'un demi-million de marqueurs génétiques dans l' ADN de ces 3.500 personnes. Plus précisément, ils se sont concentrés sur des questions en rapport avec le polymorphisme nucléotidique ou polymorphisme d'un seul nucléotide ( SNP, Single-Nucleotide Polymorphism ).  [...]

L'hépatite C sera mieux traitée grâce à l'interféron lambda

Les chercheurs ont utilisé des puces à ADN, outils très en vogue et très commodes pour analyser un grand nombre de gènes en un temps record. De cette manière, il a été possible de mettre en évidence un polymorphisme lié à un seul nucléotide ( SNP pour single nucleotid polymorphism ) dans la réponse différentielle à la bithérapie.  [...] Les chercheurs ne se sont pas arrêtés là. ils savaient d'où venait le problème, ils n'avaient plus qu'à essayer de le résoudre. Des patients en phase clinique 1B sont actuellement traités par la molécule clé. l'interféron lambda. D'après le Dr. Kutalik, premier auteur de l'article, les résultats semblent encourageants.  [...]

Changement climatique : l'étonnante adaptation des plantes

Cette plante est en effet un modèle très utilisé par les chercheurs, il existe donc beaucoup de données à son sujet, et ce pour différents environnements et latitudes. Une aubaine pour les auteurs de l'étude parue le mois dernier dans Science, qui ont observé le génotype de différents spécimens d' A.  [...] Les chercheurs se sont notamment intéressés à certaines sections du génome, les SNP ( Single Nucleotid Polymorphism ). Ces zones correspondent à un changement d'une seule base entre les génotypes de deux individus et se déclinent sous deux formes.  [...]

Un projet pour séquencer mille génomes

Comme pour le projet Génome humain, c'est un consortium international de recherche qui part à l'assaut de ces SNP. Il réunit des équipes du U.S. National Human Genome Research Institute (Etats-Unis), du Sanger Institute (Royaume-Uni) et de l'Institut de génomique de Pékin (Chine).  [...] Il restera ensuite la tâche la plus importante. s'attaquer aux génomes de mille personnes, donneurs volontaires et anonymes, dont les origines seront les plus variées possibles, comme cela avait été fait pour HapMap.   [...]

Science décalée : les plus grands sont les plus intelligents

Ce qui est petit est mignon. Ce qui est grand est intelligent. Si la première affirmation reste encore à prouver, la seconde vient d'être attestée par une équipe de chercheurs écossais, affiliés à l' université d'Édimbourg. Il existerait des variations génétiques favorisant à la fois la taille et le quotient intellectuel (QI).  [...] Plus précisément, 58 % de la variabilité de la taille et 28 % des variations de l'intelligence seraient associées aux SNP, d'après la recherche. Les deux paramètres seraient liés avec une probabilité de 28 %, et la majorité (71 %) des corrélations phénotypiques s'expliqueraient par les concordances génétiques.  [...]