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L'évolution des bactéries sous l'oeil des scientifiques depuis 24 ans !

En pratique, les chercheurs ont séquencé l'intégralité du génome bactérien à différents temps au cours de l'évolution (171 clones bactériens au total). Les données ont été intégrées à la plateforme MicroScope, développée au Génoscope, et comparées au génome de l'ancêtre.  [...] Grâce à cette expérience d'évolution en tube à essai dévoilée dans la revue Pnas, les chercheurs ont pu comprendre les différentes étapes qui président in vivo à l'apparition de bactéries mutantes. De telles bactéries hypermutatrices sont connues pour être associées à de graves problèmes de santé publique, comme l'apparition de maladies nosocomiales et de bactéries multi-résistantes aux antibiotiques, ou de certains types de tumeurs chez les eucaryotes.  [...]

Rétro 2008 : la vie est toujours aussi belle !

En 2008, la vie a surpris les biologistes. Chez les animaux, les végétaux ou les micro-organismes, d'étonnantes prouesses ont été révélées cette année. Même les chercheurs se sont surpris eux-mêmes en parvenant à cloner des souris mortes ou en retrouvant les gènes du mammouth.  [...] A partir de fragments de chair et de peau provenant du thylacine, un marsupial disparu, des chercheurs ont isolé un gène et l'ont rendu fonctionnel en l'intégrant dans un génome de souris. Ce résultat est une première et laisse espérer un nouveau moyen d'étudier des espèces récemment éteintes, ainsi qu'une meilleure connaissance des mécanismes de l'évolution.  [...]

Nouvelle énigme autour du virus géant Mimivirus

Les chercheurs du laboratoire Information génomique et structurale (CNRS, Marseille) participent en 2003 à la découverte, chez une amibe, du plus grand virus à ADN jamais recensé, Mimivirus. En 2004, ils analysent son génome et y trouvent des gènes inhabituels chez les virus.  [...] Les chercheurs en concluent qu'au moins la moitié des gènes de Mimivirus a une origine commune, et probablement très ancienne. Le génome de Mimivirus n'est donc pas un sac de gènes aléatoirement constitué, mais une structure qui a préservé une grande homogénéité au cours de son évolution.  [...]

Cancer : les éléphants préservés grâce à un gène zombie

Dans des travaux précédents, les chercheurs ont trouvé dans le génome de l'éléphant plusieurs copies du gène p53, un gène suppresseur de tumeur. mais ils ne comprenaient toujours pas pourquoi l'éléphant résistait de la sorte au cancer. Parfois, au cours de l'évolution, de nouveaux phénotypes apparaissent à cause de changements dans des régions non codantes de l'ADN.  [...] Les chercheurs ont ainsi identifié des milliers de régions d'évolution accélérée dans le génome de chaque animal. Certaines de ces régions pouvaient être responsables de traits caractéristiques de ces espèces, comme les ailes de la chauve-souris ou la taille de l'éléphant.  [...]

A l'origine du cerveau : les éponges de mer !

Les voies de l'évolution sont décidément étonnantes. On imagine la stupéfaction d'un groupe de chercheurs de l'Université de Santa Barbara en Californie lorsqu'ils ont découvert que le génome des éponges de mer possédait un nombre important de composantes en commun avec celles intervenant dans le fonctionnement des synapses humaines.  [...] La conclusion qui s'est imposée aux chercheurs est donc que là, comme dans d'autres exemples, l'évolution sait faire du neuf avec du vieux en réutilisant des éléments autrefois dédiés à des fonctions bien différentes.  [...]

Du génome de la souris à celui de l'homme

Le séquençage du génome de la souris, complété récemment, va probablement apporter son lot de révolutions scientifiques. Avec ses 2,5 milliards de nucléotides, il est 14% plus petit que le génome humain. L'homme et la souris ( Mus musculus ) possèdent 99% de gènes homologues (c'est-à-dire identiques ou proches).  [...] Le génome des eucaryotes est composé de séquences dites codantes (les gènes ) qui permettent l'expression d'une protéine ou d'un ARN, mais aussi de séquences non codantes pour lesquelles aucune fonction n'a pu être déterminée. Certains chercheurs ont même parlé d' ADN poubelle, pensant que ces larges fragments d'ADN pouvaient être des résidus de l'évolution.  [...]

Les pseudogènes vont-ils bouleverser la biologie ?

000 gènes destinés à être traduits en protéines. Le reste, disait-on, ne serait que des vestiges des gènes ancestraux ou même des séquences muettes, soi-disant voués à diluer les potentielles mutations acquises par le génome au cours de l' évolution. Pourtant, de plus en plus, les chercheurs découvrent que les zones non codantes sont aussi d'une importance capitale.  [...] Ainsi, ces pseudogènes entrent en compétition avec les gènes fonctionnels pour l'interaction avec les miRNA. les chercheurs les ont surnommés competitive endogenous RNA ou ceRNA. Si ces pseudogènes sont capables de réguler l'expression du génome, c'est toute la biologie qu'il faut repenser.  [...]

Mort subite des chênes : séquençage du génome de l'agent phytopathogène

Une équipe de chercheurs américains, menée par Brett Tyler de l'Institut de Bio-Informatique de Virginie, et Dan Rokhsar du Joint Genome Institute en Californie, vient de réaliser le séquençage du génome du champignon pathogène Phytophthora ramorum, relançant l'espoir d'une lutte biologique contre ce parasite.  [...] Les chercheurs américains ont présenté leurs travaux le jeudi 10 juin, au Joint Genome Institute, révélant un génome de 65 millions de paires de bases comprenant quelques 15.000 gènes. L'équipe espère que la carte du génome de P. ramorum permettra d'identifier des gènes codant pour des protéines clés du parasite, ce qui permettra alors la conception de tests de dépistage et des traitements.  [...]

La bactérie E. coli recréée avec un génome entièrement artificiel et compressé

C'est le plus grand génome jamais reconstitué. des chercheurs ont réussi à fabriquer en laboratoire les quatre millions de paires de bases de la bactérie Escherichia coli, et même à le compresser. Or un génome plus simple, c'est autant de place libérée pour intégrer de nouvelles fonctionnalités.  [...] Pour créer cette version simplifiée du génome d' E. coli, l'équipe de Jason Chin a entrepris de réduire ses redondances. Les chercheurs ont rentré la totalité de l'ADN de la bactérie dans un ordinateur et l'ont traité un peu comme un fichier texte, effectuant une fonction de recherche et de remplacement à plus de 18.  [...]

Patient hors norme : elle ne ressent ni douleur ni anxiété

Les chercheurs de l'UCL ( University College London ) et d'Oxford se sont donc intéressés à son cas et ont trouvé deux mutations intéressantes dans son génome. L'une concernait un pseudogène, appelé FAAH-OUT, dont on pensait jusqu'à présent qu'il n'était pas fonctionnel.  [...] L'anandamide est normalement dégradé par l'enzyme FAAH. Pour les chercheurs, cette concentration anormale d'anandamide était le signe d'un signal élevé du système endocannabinoïde et de l'absence de fonctionnement de l'enzyme FAAH.  [...]